Los inhibidores de Ypk2 se dirigen principalmente a quinasas o complejos de señalización que contribuyen a la fosforilación y posterior activación de Ypk2. Por ejemplo, Wortmannin y LY294002 actúan como inhibidores de PI3K y, por tanto, atenúan la actividad de PDK1, que es esencial para la fosforilación y activación de Ypk2. Este preciso mecanismo de acción garantiza que Ypk2 permanezca en un estado menos activo, lo que repercute en procesos posteriores como el metabolismo lipídico y las vías de supervivencia celular que están bajo el control regulador de Ypk2. GSK2334470 y UCN-01 son inhibidores específicos de PDK1 que fosforilan en sitios clave de activación de Ypk2, volviéndola enzimáticamente inactiva.
Otro conjunto significativo de compuestos como Rapamycin, KU-0063794, y PP242 inhiben los complejos mTOR, particularmente TORC2, que es un directo de Ypk2. Al bloquear la fosforilación mediada por TORC2, estos inhibidores reducen sustancialmente la activación de Ypk2. Además, el MK-2206 actúa mediante la inhibición de Akt, reduciendo los bucles de retroalimentación que, de otro modo, regularían al alza la PDK1 y, posteriormente, la Ypk2. Algunos inhibidores, como el NVP-BEZ235, presentan efectos inhibidores duales sobre PI3K y mTOR, lo que proporciona un bloqueo completo de las vías de activación de Ypk2. Esta diversificación de la diana permite una inhibición más amplia, aunque específica, de las funciones enzimáticas de Ypk2.
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