Los inhibidores químicos de la tiamina trifosfatasa (THTPA) incluyen una serie de compuestos que interfieren con el metabolismo del folato y los procesos celulares dependientes del pirofosfato de tiamina (TPP), la forma activa de la tiamina que la THTPA ayuda a generar. El metotrexato, la aminopterina y el pralatrexato son inhibidores de la dihidrofolato reductasa (DHFR), una enzima crucial para la síntesis del folato. Al inhibir la DHFR, estas sustancias químicas reducen la producción de derivados del folato, con lo que disminuye la demanda celular de TPP. La menor demanda de TPP implica una menor necesidad de la actividad enzimática del THTPA, reduciendo su papel dentro de la célula. Del mismo modo, el raltitrexed y el pemetrexed actúan sobre la timidilato sintasa y otras enzimas dependientes del folato, lo que provoca una disminución de la timidina monofosfato (TMP), un nucleótido necesario para la síntesis del ADN que depende de los cofactores del folato. La inhibición de estas vías por raltitrexed y pemetrexed también sugiere una menor necesidad celular de TPP, disminuyendo así la actividad del THTPA.
Otros inhibidores, como el 5-fluorouracilo, producen metabolitos como el monofosfato de fluorodesoxiuridina (FdUMP) que dificultan la timidilato sintasa, afectando a la síntesis de ADN y, en consecuencia, disminuyendo la demanda de procesos ligados al TPP. Puede considerarse que la trimetoprima y la pirimetamina, aunque se centran principalmente en la DHFR bacteriana y parasitaria, tienen un efecto indirecto sobre la DHFR humana. Esta acción sugeriría de forma similar una reserva reducida de folato y, por tanto, una menor demanda de actividad de TPP y THTPA. Agentes como el sulfametoxazol y el triamtereno, aunque no se dirigen directamente a las enzimas de síntesis de folato, pueden provocar una disminución de los niveles de folato en las células a través de la inhibición de la captación o síntesis de folato, lo que a su vez reduciría las necesidades de TPP. Por último, la fluorofenilalanina y el cicloguanil, aunque no están directamente relacionados con el metabolismo del folato, también pueden provocar una reducción de la actividad metabólica celular que se traduce en una menor necesidad de TPP y de la actividad catalítica del THTPA.
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