DUB3 Inhibidores

Inhibidores comunes de DUB3 incluyen, pero no se limitan a Actinomicina D CAS 50-76-0, α-Amanitina CAS 23109-05-9, Doxorrubicina CAS 23214-92-8, 5-Azacitidina CAS 320-67-2 y Mitramicina A CAS 18378-89-7.

Los inhibidores de DUB3 se refieren a una clase de compuestos químicos diseñados específicamente para atacar e inhibir la actividad de la enzima deubiquitinadora conocida como DUB3, también denominada USP17 (peptidasa 17 específica de ubiquitina) o USP17L2. Las enzimas deubiquitinadoras (DUB) desempeñan un papel fundamental en el proceso de ubiquitinación, que es una modificación postraduccional en la que las proteínas ubiquitinas se unen a una proteína sustrato, marcándola para su degradación o alterando su localización o actividad celular. Los DUB, como DUB3, invierten este proceso eliminando las moléculas de ubiquitina de los sustratos, regulando así la proteostasis y otras vías de señalización celular. Como tales, los inhibidores de DUB3 se unirían a los sitios activos de esta enzima, afectando potencialmente a su actividad catalítica. La inhibición de DUB3 afectaría al equilibrio entre la ubiquitinación y la desubiquitinación en las células, lo que podría tener varios efectos secundarios en las funciones celulares y las vías de señalización.

El desarrollo de inhibidores de DUB3 empezaría por comprender la estructura y función de la enzima. Para determinar la estructura tridimensional de DUB3 podrían utilizarse herramientas de biología estructural como la cristalografía de rayos X, la resonancia magnética nuclear (RMN) y la criomicroscopía electrónica. Con esta información estructural, los científicos pueden identificar los sitios activos y los sitios alostéricos potenciales que son cruciales para la actividad deubiquitadora de la enzima. A continuación, podrían emplearse métodos de cribado de alto rendimiento para buscar pequeñas moléculas que presenten afinidad de unión con estos sitios de DUB3. Estos resultados iniciales se validarían mediante diversos ensayos in vitro diseñados para medir los efectos inhibidores de los compuestos sobre la actividad enzimática de DUB3. Por ejemplo, los ensayos que utilizan fluorescencia o electroquimioluminiscencia pueden detectar la liberación de ubiquitina de proteínas sustrato, indicando así la eficacia de los inhibidores.