Chemische Inhibitoren von ADAT2 können auf der Grundlage ihrer Fähigkeit ausgewählt werden, zelluläre Prozesse zu stören, die für die Funktion des Proteins wesentlich sind. Methylenblau kann durch Hemmung der Stickoxid-Synthase die Stickoxidkonzentration in den Zellen senken, was wiederum den RNA-Stoffwechsel beeinträchtigen und indirekt die Rolle von ADAT2 bei der tRNA-Modifikation hemmen kann. Bleiacetat könnte ADAT2 durch Bindung an seine essenziellen Metallionen hemmen, während Natriumarsenit Enzyme mit kritischen Cysteinresten hemmen kann, die, falls sie in ADAT2 vorhanden sind, dessen Funktion beeinträchtigen würden. Chloroquin verändert den pH-Wert intrazellulärer Kompartimente wie z. B. Lysosomen, wodurch der Transport oder Abbau von ADAT2 gestört werden könnte. Brefeldin A zielt auf den Proteinverkehr zwischen dem endoplasmatischen Retikulum und dem Golgi ab, und wenn ADAT2 diesen Weg für eine ordnungsgemäße Faltung oder Reifung benötigt, würde seine Funktion beeinträchtigt werden.
Andererseits hemmt 3-Methyladenin die Autophagie, einen Prozess, der ADAT2 unter bestimmten Bedingungen abbauen könnte, was zu einer Anhäufung von möglicherweise nicht funktionsfähigen Formen des Proteins führen würde. MG132 blockiert den proteasomalen Abbau, einen Weg, der den ADAT2-Umsatz regulieren könnte, was zu einer Anhäufung von defektem ADAT2-Protein führt. Verbindungen wie Cycloheximid und Puromycin unterbrechen die Proteinsynthese, was die Wiederauffüllung der ADAT2-Spiegel in der Zelle verhindern und damit indirekt die Aktivität des Proteins hemmen würde. Actinomycin D und α-Amanitin hemmen die RNA-Synthese, was die Verfügbarkeit von tRNA-Substraten, die für die Modifizierungsfunktionen von ADAT2 erforderlich sind, verringern könnte, wodurch die Aktivität von ADAT2 im Wesentlichen dadurch eingeschränkt wird, dass ihm seine Substrate vorenthalten werden. Schließlich unterbricht Camptothecin die DNA-Replikationsprozesse, was zu einem zellulären Umfeld führt, das für die Proteinsynthese, einschließlich der Synthese von ADAT2, weniger förderlich ist, wodurch die funktionelle Präsenz von ADAT2 in der Zelle verringert wird.
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