Los inhibidores de la 4-fosfatasa α de tipo I incluirían una amplia gama de compuestos, dada la falta de especificidad de la 4-fosfatasa α de tipo I. En general, los inhibidores de la fosfatasa funcionan imitando el estado de transición del sustrato natural de la enzima, quelando los iones metálicos necesarios en el sitio activo o uniéndose a los residuos del sitio activo para impedir la catálisis.
Inhibidores como el ortovanadato sódico y el fluoruro sódico actúan imitando grupos fosfato o formando complejos con iones metálicos catalíticos. La cantaridina y la caliculina A son toxinas naturales que inhiben las proteínas fosfatasas mediante modificación covalente o uniéndose fuertemente al sitio activo. El ácido okadaico y la microcistina-LR, ambos producidos por organismos marinos, son potentes inhibidores de la PP2A y la PP1, utilizados a menudo en la investigación para estudiar los procesos de fosforilación celular. La tautomicetina es un inhibidor más selectivo que permite la inhibición diferencial de las fosfatasas.
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