TXNDC13活性化因子には主に、小胞体(ER)ストレスを誘導したり、タンパク質のフォールディングを破壊したりする分子が含まれ、それによってTXNDC13のタンパク質ジスルフィド異性化酵素活性の需要を間接的に増加させる。例えば、タプシガルギン、A23187、ブレフェルジンA、モネンシン、シクロピアゾン酸は様々なメカニズムで小胞体ストレスを誘導する。TapsigarginとCyclopiazonic AcidはSERCAポンプを阻害し、ERのカルシウム貯蔵量を枯渇させ、A23187は細胞のカルシウムホメオスタシスを破壊し、Monensinは細胞のイオン勾配を破壊する。ブレフェルジンAは小胞体からゴルジ体へのタンパク質輸送を阻害し、小胞体へのタンパク質の蓄積、ひいては小胞体ストレスを引き起こす。小胞体内のアンフォールディングタンパク質やミスフォールディングタンパク質の負荷の増大に対応して、TXNDC13は活性化され、タンパク質のフォールディングとジスルフィド結合形成を助ける。
一方、還元剤であるDTTは、ジスルフィド結合の形成と再配列の要求を高めることによって、間接的にTXNDC13を活性化することができる。TunicamycinはN-結合型グリコシル化を阻害し、TXNDC13がタンパク質のフォールディングを補助することで対応できるグリコシル化欠損をもたらす。同じように、2-デオキシ-D-グルコースは、細胞ストレスの増加とミスフォールディングタンパク質の増加により、間接的にTXNDC13を活性化する。ER関連分解を阻害するEeyarestatin Iもまた、ミスフォールディングタンパク質のERへの蓄積を引き起こし、間接的にTXNDC13を活性化する。
4-フェニル酪酸ナトリウムやタウロウルソデオキシコール酸のようなケミカルシャペロンもまた、タンパク質の折り畳み補助の要求を増大させることにより、TXNDC13を間接的に活性化する。同様に、MG-132はミスフォールディングタンパク質の蓄積を引き起こすことによって間接的にTXNDC13を活性化することができる。
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