Los inhibidores químicos de la proteína Tim22 actúan alterando los procesos mitocondriales esenciales para su actividad en la importación de proteínas. La antimicina A, por ejemplo, se dirige al Complejo III de la cadena de transporte de electrones, obstaculizando la respiración mitocondrial y la generación de ATP, de los que depende Tim22 para la translocación de proteínas. Con un mecanismo similar, la Oligomicina A y la Oligomicina se unen a la ATP sintasa, bloqueando la producción de ATP y privando así a Tim22 de la energía necesaria para funcionar. La venturicidina A también inhibe la ATP sintasa, pero lo hace obstruyendo la translocación de protones a través de la región F_o, que es crucial para la síntesis de ATP. Esta acción da lugar a un suministro reducido de ATP, inhibiendo así la función de Tim22.
Además, la CCCP actúa como protonóforo para disipar el gradiente de protones, que es fundamental para mantener el potencial de membrana que Tim22 utiliza para su mecanismo de importación de proteínas. La aurovertina B, al unirse a la subunidad β de la F_1-ATPasa, impide la formación de ATP, lo que afecta a la actividad translocasa de Tim22. La concanamicina A interrumpe los gradientes de protones al inhibir la ATPasa de tipo V, lo que conduce a un resultado similar al de la CCCP. Rotenona y Piericidina A inhiben el Complejo I, reduciendo el gradiente de protones necesario para la síntesis de ATP, lo que a su vez afecta a la actividad de Tim22. Por último, el ácido bongkrekico y la atovaquona perturban la función de Tim22 por sus efectos sobre el translocador de nucleótidos de adenina y el Complejo III, respectivamente, al impedir el intercambio ADP/ATP a través de la membrana interna mitocondrial o al interferir con el componente citocromo b, ambos cruciales para la síntesis de ATP y, en consecuencia, para el funcionamiento de Tim22.
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