Set1 Attivatori

Gli attivatori comuni di Set1 includono, a titolo esemplificativo ma non esaustivo, il butirrato di sodio CAS 156-54-7, la 5-azacitidina CAS 320-67-2, la tricostatina A CAS 58880-19-6, la nicotinammide CAS 98-92-0 e l'acido suberoilanilide idrossamico CAS 149647-78-9.

Gli attivatori di Set1, come classe chimica, sono composti in grado di influenzare il paesaggio epigenetico di una cellula, facilitando in particolare l'attività della proteina Set1. Queste molecole non si legano direttamente a Set1 o lo attivano, ma modulano il contesto cellulare in cui Set1 opera, principalmente influenzando la struttura e l'accessibilità della cromatina. Ad esempio, molti attivatori di Set1 sono inibitori dell'istone deacetilasi (HDACI). Gli HDACI, come la tricostatina A, il Vorinostat, l'acido valproico e il fenilbutirrato di sodio, aumentano l'acetilazione degli istoni, una modifica che in genere rende la cromatina più aperta e accessibile al macchinario trascrizionale, compreso il complesso COMPASS di cui Set1 è un componente. Aumentando l'accessibilità della cromatina, questi HDACI possono potenziare la capacità di Set1 di aggiungere gruppi metilici all'istone H3 alla lisina 4 (H3K4) e quindi promuovere l'attivazione trascrizionale.

Gli attivatori di Set1 sono in grado di influenzare altri aspetti del metabolismo cellulare e della regolazione epigenetica che potrebbero potenziare indirettamente l'attività di Set1. Ad esempio, l'analogo della citosina 5-azacitidina può inibire le DNA metiltransferasi, portando a una diminuzione della metilazione del DNA, un cambiamento che potrebbe potenzialmente aumentare l'acetilazione degli istoni e quindi la capacità di Set1 di metilare l'istone H3. Allo stesso modo, il 2-Deossi-D-glucosio, la metformina e la curcumina possono influenzare il metabolismo cellulare, che a sua volta potrebbe influenzare la modificazione degli istoni e quindi l'attività di Set1. Infine, il resveratrolo e l'EGCG sono noti per inibire le sirtuine, una classe di deacetilasi, che potrebbe portare a un aumento dell'acetilazione degli istoni e a una maggiore attività di Set1. L'insieme di questi composti evidenzia i diversi modi in cui l'attività di Set1 può essere indirettamente potenziata attraverso modifiche del contesto cellulare, in particolare alterazioni della struttura e dell'accessibilità della cromatina.