RFX1阻害剤は、いくつかの遺伝子の転写制御に関与しているDNA結合タンパク質であるRFX1の制御機能に間接的に影響を与える様々な化合物を含んでいる。これらの化合物は、RFX1の転写活性の前提条件となる、関連するシグナル伝達経路や細胞プロセスを標的とすることによって、これを達成する。これには、クロマチン構造、DNAメチル化パターン、プロテアソーム機能、AP-1やNF-κBを介するような様々なシグナル伝達カスケードの調節が含まれる。例えば、JQ1やI-BET151のような化合物は、BETブロモドメインによるアセチル化ヒストンの読み取りを阻害し、これはRFX1のような転写因子が遺伝子プロモーターに適切に位置するために重要である。SR11302はAP-1を阻害するので、RFX1が関与する転写プログラムに下流から影響を及ぼす可能性がある。
さらに、RFX1標的遺伝子の転写に重要な役割を果たすRNAポリメラーゼII複合体を標的とするトリプトライドによって、細胞内の転写機構が影響を受ける可能性がある。デシタビンや5-アザシチジンのようなエピジェネティック修飾剤はDNAのメチル化状態を変化させ、RFX1が相互作用するゲノム景観を変化させる可能性があり、一方MG132はプロテアソーム分解を阻害し、RFX1と競合または相互作用する制御タンパク質の蓄積につながる可能性がある。ウィザフェリンAとクルクミンは、RFX1と協調的または拮抗的に機能する因子であるNF-κBの活性を変化させる。チェトミンやエピガロカテキンガレートのような薬剤は、それぞれタンパク質間相互作用やDNAメチル化酵素を阻害し、RFX1が役割を果たす転写活性を調節する。最後に、オリゴマイシンAによる細胞エネルギーへの影響は、転写過程のエネルギー依存性の性質により、間接的にRFX1の機能に影響を与える可能性がある。これらの化学物質は、その多様な作用様式を通して、細胞内のRFX1活性を調節するための広範かつ間接的なアプローチを確立している。
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