Les mécanismes d'action des inhibiteurs chimiques de la PASK peuvent être divers, chacun ciblant la kinase de différentes manières pour parvenir à l'inhibition. La staurosporine est un inhibiteur de kinase bien connu qui agit en occupant le site de liaison de l'ATP de la PASK, essentiel à son activité kinase. Cette inhibition compétitive empêche la PASK de phosphoryler ses substrats, ce qui entraîne une inhibition fonctionnelle de son activité. De même, le H-89 cible le site de liaison de l'ATP de la PASK, agissant comme un compétiteur et entravant ainsi l'action catalytique de l'enzyme. L'inhibition est également observée avec la 5-Iodotubercidine qui, en entrant en compétition avec l'ATP, peut bloquer l'action de phosphorylation que la PASK est censée effectuer. Le K252a, un autre inhibiteur de kinase, se fixe sur le même site et empêche l'ATP d'entrer en contact avec la PASK, ce qui empêche la kinase d'exercer sa fonction normale.
En outre, des composés comme l'indirubine-3'-monoxime et la roscovitine perturbent l'activité kinase de la PASK en empêchant l'ATP de se lier à son site actif, une étape cruciale pour le fonctionnement de la kinase. Le SP600125, bien qu'il soit principalement un inhibiteur de la JNK, peut également inhiber la PASK en bloquant le domaine de liaison de l'ATP, empêchant ainsi l'activation. Le SB 203580 et le PD 98059 exercent leurs effets inhibiteurs sur la PASK en interférant avec le processus de phosphorylation, qui est une activité critique de la PASK. LY294002 et Wortmannin ciblent la voie PI3K/AKT, qui est indirectement liée aux fonctions régulatrices de la PASK. En inhibant PI3K, ces composés réduisent les événements de signalisation en aval qui contribueraient autrement à l'activation de la PASK. La rapamycine, un inhibiteur de mTOR, perturbe la voie de détection des nutriments et de l'énergie, qui est intimement liée aux fonctions régulatrices de la PASK, ce qui entraîne une diminution de l'activité de la PASK dans le cadre de l'inhibition plus large de la voie.
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