Gli inibitori chimici di FKBP52 possono esercitare la loro azione inibitoria attraverso una varietà di meccanismi, che comportano tutti l'interruzione dell'interazione di FKBP52 con proteine chiave che sono vitali per la sua funzione. Il mifepristone, ad esempio, può legarsi ai recettori dei glucocorticoidi, che notoriamente si associano a FKBP52, inibendo così la maturazione e la traslocazione di questi complessi ormone-recettore nel nucleo. Questa inibizione impedisce il corretto funzionamento dei recettori dei glucocorticoidi, a cui FKBP52 contribuisce normalmente. Analogamente, Radicicol e Geldanamicina hanno come bersaglio Hsp90, una proteina da shock termico che forma un complesso con FKBP52 ed è essenziale per il suo ruolo nel ripiegamento e nel funzionamento dei recettori degli ormoni steroidei. Legandosi a Hsp90, questi inibitori interrompono l'interazione FKBP52-Hsp90, determinando un'inibizione funzionale del ruolo di FKBP52 nel ciclo chaperone e nella localizzazione cellulare dei recettori steroidei. Anche Withaferin A e Celastrol inibiscono FKBP52 legandosi a Hsp90, impedendo così l'associazione tra Hsp90 e FKBP52, fondamentale per il corretto funzionamento dei recettori degli ormoni steroidei.
L'inibizione di FKBP52 può essere ottenuta anche attraverso altri inibitori di Hsp90, come 17-AAG (Tanespimicina), Onalespib, BIIB021, SNX-2112 e PF-04929113 (SNX-5422), che interrompono il ciclo chaperone di Hsp90. Questi inibitori impediscono la formazione del complesso proteico che coinvolge FKBP52, necessario per la traslocazione nucleare e la funzione dei recettori degli ormoni steroidei. Novobiocin e Debio 0932, inibendo il dominio C-terminale di Hsp90, interrompono anche la sua interazione con FKBP52, che è fondamentale per la maturazione e la funzione FKBP52-dipendente dei recettori ormonali. Prendendo di mira il ciclo chaperone di Hsp90 e la sua interazione con FKBP52, questi inibitori contribuiscono a compromettere le attività funzionali di FKBP52, come la stabilizzazione e l'attività dei recettori degli ormoni steroidei ad esso associati. Questa inibizione mirata può portare a una riduzione significativa delle capacità funzionali di FKBP52 all'interno di percorsi cellulari in cui svolge un ruolo tipico nella segnalazione ormonale.
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