Os inibidores FAM98C englobam uma gama de compostos que influenciam várias vias e processos de sinalização celular. O LY294002 e a Wortmannin são dois desses inibidores que têm como alvo a via de sinalização PI3K/AKT. Ao inibir a PI3K, estes compostos impedem a fosforilação e a subsequente ativação da AKT, conduzindo a uma diminuição das actividades de sinalização a jusante que podem envolver a FAM98C. Esta redução da sinalização pode resultar numa menor atividade do FAM98C se a função do FAM98C depender de sinais propagados através da via AKT.
Para além da via PI3K/AKT, outros compostos, como o PD98059 e o U0126, visam a via MAPK/ERK, inibindo especificamente a MEK1/2. Esta inibição resulta numa menor ativação da ERK, uma quinase que pode fosforilar e regular o FAM98C.
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