Gli attivatori chimici della RNA 5'-fosfato e 3'-OH ligasi 1 svolgono un ruolo cruciale nel facilitare le sue funzioni enzimatiche. L'ATP è un attivatore primario e fornisce il gruppo fosfato necessario per la reazione di ligazione, che è un passo fondamentale nel processo di attivazione. Questo coinvolgimento diretto dell'ATP dà energia alla reazione di ligazione, che è centrale nel processo catalitico. Analogamente, il GTP può contribuire come donatore di nucleotidi guanina, partecipando ulteriormente all'attivazione della funzione di ligazione dell'enzima. Il NAD+ è un altro attivatore essenziale richiesto per la fase di adenilazione nel ciclo catalitico dell'enzima, mentre il mononucleotide nicotinammidico (NMN) è coinvolto nell'adenilazione del gruppo 5'-fosfato dell'RNA, un passaggio fondamentale nel processo di ligazione.
Inoltre, l'attività della RNA 5'-fosfato e 3'-OH ligasi 1 è significativamente influenzata dalla presenza di vari cofattori e stabilizzatori. Il cloruro di magnesio e il cloruro di manganese fungono da cofattori: il magnesio è essenziale per l'attività catalitica della ligasi, favorendo il corretto ripiegamento e l'orientamento necessari per la catalisi. Il manganese, invece, può sostituire il magnesio e attivare la funzione enzimatica stabilizzando lo stato di transizione e migliorando le interazioni con il substrato. Anche il cloruro di zinco può attivare l'attività della ligasi, potenzialmente stabilizzando la struttura dell'enzima o essendo coinvolto nel meccanismo catalitico. I cationi bivalenti come il calcio sono indispensabili per l'attività dell'enzima, in quanto migliorano il legame con il substrato e la catalisi. Il cloruro di potassio influisce sulla forza ionica e sulla stabilità conformazionale dell'enzima, essenziale per la sua attività. Il solfato di ammonio viene utilizzato per stabilizzare la conformazione dell'enzima, aumentandone potenzialmente l'efficienza catalitica. Il ditiotreitolo (DTT) mantiene i residui di cisteina in uno stato ridotto, fondamentale per la conformazione attiva dell'enzima. Infine, la spermidina può stabilizzare la struttura dell'RNA, aumentando l'affinità di legame della ligasi ai suoi substrati di RNA e facilitando così l'attivazione della funzione di ligasi dell'enzima.
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Nome del prodotto | CAS # | Codice del prodotto | Quantità | Prezzo | CITAZIONI | Valutazione |
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ADP | 58-64-0 | sc-507362 | 5 g | $53.00 | ||
L'ATP attiva direttamente la RNA 5'-fosfato e la 3'-OH ligasi 1 fornendo il gruppo fosfato necessario per il processo di ligazione, dando così energia alla reazione di ligazione. | ||||||
Magnesium chloride | 7786-30-3 | sc-255260C sc-255260B sc-255260 sc-255260A | 10 g 25 g 100 g 500 g | $27.00 $34.00 $47.00 $123.00 | 2 | |
Il cloruro di magnesio funge da cofattore necessario per l'attività catalitica dell'RNA 5'-fosfato e 3'-OH ligasi 1, facilitando il corretto ripiegamento e l'orientamento della ligasi per la catalisi. | ||||||
Guanosine-5′-Triphosphate, Disodium salt | 86-01-1 | sc-507564 | 1 g | $700.00 | ||
Il GTP può servire come donatore di nucleotidi guanina nella reazione di ligazione catalizzata dall'RNA 5'-fosfato e 3'-OH ligasi 1, partecipando così all'attivazione della funzione di ligazione dell'enzima. | ||||||
Manganese(II) chloride beads | 7773-01-5 | sc-252989 sc-252989A | 100 g 500 g | $19.00 $30.00 | ||
Il cloruro di manganese può agire come cofattore per l'RNA 5'-fosfato e 3'-OH ligasi 1, come il magnesio, e può attivare la funzione enzimatica stabilizzando lo stato di transizione e migliorando l'interazione con i substrati. | ||||||
Zinc | 7440-66-6 | sc-213177 | 100 g | $47.00 | ||
Lo zinco cloruro potrebbe stabilizzare la struttura dell'RNA 5'-fosfato e 3'-OH ligasi 1 o partecipare al meccanismo catalitico, attivando così l'attività ligasica dell'enzima. | ||||||
Potassium Chloride | 7447-40-7 | sc-203207 sc-203207A sc-203207B sc-203207C | 500 g 2 kg 5 kg 10 kg | $25.00 $56.00 $104.00 $183.00 | 5 | |
Il cloruro di potassio può influenzare la forza ionica e la stabilità conformazionale dell'RNA 5'-fosfato e 3'-OH ligasi 1, che è essenziale per la sua attività enzimatica e serve quindi come attivatore. | ||||||
Ammonium Sulfate | 7783-20-2 | sc-29085A sc-29085 sc-29085B sc-29085C sc-29085D sc-29085E | 500 g 1 kg 2 kg 5 kg 10 kg 22.95 kg | $10.00 $20.00 $30.00 $40.00 $60.00 $100.00 | 9 | |
Il solfato di ammonio può essere usato per stabilizzare la conformazione dell'RNA 5'-fosfato e 3'-OH ligasi 1, il che può aumentare l'efficienza catalitica dell'enzima e attivare la sua funzione di ligasi. | ||||||
NAD+, Free Acid | 53-84-9 | sc-208084B sc-208084 sc-208084A sc-208084C sc-208084D sc-208084E sc-208084F | 1 g 5 g 10 g 25 g 100 g 1 kg 5 kg | $56.00 $186.00 $296.00 $655.00 $2550.00 $3500.00 $10500.00 | 4 | |
Il NAD+ è necessario per la fase di adenilazione nella reazione di ligazione catalizzata dall'RNA 5'-fosfato e 3'-OH ligasi 1, attivando così direttamente il processo di ligazione dell'enzima. | ||||||
Spermidine | 124-20-9 | sc-215900 sc-215900B sc-215900A | 1 g 25 g 5 g | $56.00 $595.00 $173.00 | ||
La spermidina stabilizza la struttura dell'RNA e potrebbe aumentare l'affinità di legame dell'RNA 5'-fosfato e della 3'-OH ligasi 1 ai suoi substrati di RNA, attivando così la funzione di ligasi dell'enzima. | ||||||
β-Nicotinamide mononucleotide | 1094-61-7 | sc-212376 sc-212376A sc-212376B sc-212376C sc-212376D | 25 mg 100 mg 1 g 2 g 5 g | $92.00 $269.00 $337.00 $510.00 $969.00 | 4 | |
L'NMN può essere coinvolto nell'adenilazione del 5'-fosfato dell'RNA, che è un passaggio critico nel processo di ligazione catalizzato dall'RNA 5'-fosfato e dalla 3'-OH ligasi 1, attivando così l'enzima. |