Os inibidores da quinase PLEKHH3, como a Wortmannin, LY294002, PD98059, SP600125 e SB203580, têm como alvo várias cinases como a PI3K, MEK, JNK e p38 MAPK, que são fundamentais na transdução de sinais que, em última análise, afectam as vias associadas à PLEKHH3. Ao inibir estas cinases, os compostos atenuam os eventos de fosforilação que conduzem a rearranjos do citoesqueleto, à proliferação celular e a respostas ao stress, todos eles processos em que o PLEKHH3 está provavelmente implicado. Por exemplo, os inibidores da PI3K Wortmannin e LY294002 suprimem o eixo de sinalização PI3K-AKT, afectando potencialmente a dinâmica das estruturas celulares em que se pensa que a PLEKHH3 está envolvida.
Por outro lado, agentes como o NSC23766, ML141, Y-27632, Blebbistatin, SMIFH2 e CK-666 abordam diretamente a arquitetura do citoesqueleto, visando os reguladores da polimerização da actina e da contratilidade da miosina. O NSC23766 e o ML141 interrompem a ativação do Rac1 e do Cdc42, respetivamente, levando a alterações no citoesqueleto de actina ao qual o PLEKHH3 se pode associar. O Y-27632 e a Blebbistatina perturbam a maquinaria contrátil, inibindo a ROCK e a miosina II, o que pode ter impacto na tensão e na mecânica celulares, processos que são críticos para as funções celulares que se prevê que o PLEKHH3 apoie. SMIFH2 e CK-666, ao interferirem com a montagem da actina mediada pela formin e com o complexo Arp2/3, respetivamente, contribuem para a desmontagem das redes de actina a que o PLEKHH3 está provavelmente ligado. Por último, o BAPTA-AM funciona como um quelante de cálcio intracelular e o cálcio é um segundo mensageiro ubíquo envolvido em numerosas vias de sinalização, incluindo as que regem a dinâmica do citoesqueleto e o tráfego membranar. Ao quelar o cálcio, o BAPTA-AM pode atenuar as cascatas de sinalização dependentes do cálcio, possivelmente afectando a influência reguladora do PLEKHH3 sobre essas vias.
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