O membro da família Histone cluster 2, uma variante das proteínas histonas, desempenha um papel fundamental na estrutura da cromatina e na regulação dos genes. Os inibidores químicos acima referidos, todos eles inibidores da histona desacetilase, têm como alvo esta proteína, modificando o seu estado de acetilação, que, por sua vez, influencia a arquitetura e a função da cromatina. A tricostatina A, por exemplo, aumenta a acetilação das proteínas histónicas, incluindo o membro da família do cluster 2 da histona, conduzindo a uma estrutura de cromatina relaxada. Este relaxamento perturba o funcionamento normal da proteína na manutenção da cromatina compacta, essencial para a expressão genética regulada. Do mesmo modo, o butirato de sódio, ao inibir a desacetilação das histonas, eleva os níveis de acetilação das histonas, afectando a capacidade da proteína para desempenhar o seu papel na remodelação da cromatina e no controlo da expressão genética.
Continuando com inibidores como o Vorinostat, o Panobinostat e o Ácido Valpróico, estes químicos também actuam como inibidores da histona desacetilase, levando a um aumento da acetilação do membro da família do cluster 2 da histona. A consequência é uma conformação mais aberta da cromatina, que é menos propícia ao papel normal da proteína na organização da cromatina e na regulação dos genes. Os inibidores como a Romidepsina e o Belinostat funcionam de forma semelhante, mantendo níveis mais elevados de acetilação nas proteínas histónicas, afectando assim a estrutura da cromatina e o papel do membro da família do cluster 2 da histona. O entinostato, a tacedinalina, o quisinostato, o mocetinostato e o givinostato funcionam todos pelo mesmo mecanismo de inibição da histona desacetilase, levando a alterações na estrutura da cromatina através do aumento da acetilação das histonas. Estas alterações afectam a funcionalidade dos membros da família do cluster 2 da histona na remodelação da cromatina e no controlo da expressão genética. O tema consistente entre estes inibidores é a sua capacidade de perturbar a estrutura compacta normal da cromatina, crucial para o papel funcional do membro da família do cluster 2 da histona, inibindo assim a sua capacidade de participar efetivamente na organização da cromatina e na regulação dos genes.
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