Os inibidores químicos da ILT-3 podem afetar o seu papel de sinalização através de vários mecanismos de ação que visam diferentes vias celulares. A ciclosporina A, o FK506 (tacrolimus), a ascomicina e o ácido micofenólico actuam no sistema imunitário inibindo a calcineurina ou enzimas cruciais para a síntese de nucleótidos, o que leva a uma redução da ativação das células T. A atividade reduzida das células T traduz-se num menor envolvimento da ILT-3 com os seus ligandos, diminuindo efetivamente as suas capacidades de sinalização. Isto deve-se ao papel da ILT-3 na modulação imunitária, que requer interacções com outras células do sistema imunitário que são reduzidas quando estas células se encontram num estado suprimido. Do mesmo modo, a rapamicina (sirolimus) e a leflunomida têm como alvo a mTOR e a dihidroorotato desidrogenase, respetivamente, e, ao fazê-lo, limitam a proliferação e a resposta das células T. A resposta atenuada das células T limita a atividade funcional da ILT-3, uma vez que o papel da proteína está intimamente ligado ao comportamento destas células.
Além disso, os corticosteróides, como a dexametasona e a hidrocortisona, inibem indiretamente a ILT-3, induzindo a expressão de proteínas anti-inflamatórias e suprimindo a resposta imunitária. Esta ampla supressão da atividade imunitária pode levar a uma redução das vias funcionais em que a ILT-3 está ativa, uma vez que o seu envolvimento se baseia frequentemente num estado mais amplo de ativação das células imunitárias. PD98059, SB203580 e SP600125 são inibidores de cinases específicas da via MAPK, como MEK, p38 e JNK. Estas cinases estão envolvidas na regulação das respostas imunitárias, incluindo a produção de citoquinas e a diferenciação celular. A inibição destas cinases pode levar a uma redução da ativação das células imunitárias, o que, por sua vez, pode levar a uma diminuição da atividade funcional da ILT-3. A Wortmannin actua sobre a via PI3K, que é fundamental para a sobrevivência e ativação das células. Ao impedir a PI3K, a Wortmannin afecta a ativação das células T, o que pode reduzir as respostas das células imunitárias que, de outro modo, envolveriam a ILT-3 no seu papel regulador.
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