DDX40 Inibidores

Os inibidores comuns do DDX40 incluem, entre outros, o flavopiridol CAS 146426-40-6, o DRB CAS 53-85-0, o silvestrol CAS 697235-38-4, a rocaglamida CAS 84573-16-0 e a pladienolida B CAS 445493-23-2.

Os inibidores químicos do DDX40 incluem uma gama de compostos que interferem em várias fases do processamento e da tradução do ARN, nas quais a atividade da DDX40 helicase é contingente. O flavopiridol é um desses inibidores, que tem como alvo a CDK9, uma quinase envolvida na fosforilação da RNA polimerase II. Esta fosforilação é um passo crítico no processamento e maturação do mRNA, um precursor do processo de tradução do qual o DDX40 faz parte. Ao inibir a CDK9, o flavopiridol limita indiretamente a disponibilidade de modelos de ARNm maduros sobre os quais o DDX40 actuaria. Outro composto, o 5,6-dicloro-1-beta-D-ribofuranosilbenzimidazol, perturba a funcionalidade da RNA helicase A. Esta interferência pode reduzir a eficiência do desenrolar da estrutura secundária do RNA, um processo essencial para o funcionamento correto do DDX40 no metabolismo do RNA.

Mais abaixo na via de iniciação da tradução, o Hippuristanol, a Pateamina A, o Silvestrol e a Rocaglamida exercem os seus efeitos inibitórios ligando-se ao fator de iniciação eucariótico 4A (eIF4A), que desempenha um papel na atividade da RNA helicase e está associado ao processo de tradução. Ao inibir o eIF4A, esses compostos podem diminuir a atividade da helicase necessária para a tradução dos RNAs, reduzindo consequentemente a capacidade funcional do DDX40. No contexto da emenda de ARN, a pladienolida B e a espliceostatina A têm como alvo componentes do spliceossoma. Sabe-se que o DDX40 está associado ao splicing do ARN, e estes inibidores podem comprometer a capacidade do spliceossoma de remover com precisão os intrões do pré ARNm, inibindo assim potencialmente as actividades do DDX40 relacionadas com o splicing. O TBHQ, por outro lado, prejudica os mecanismos de dobragem das proteínas, o que pode resultar em proteínas DDX40 mal dobradas, levando a uma redução da sua atividade de helicase. A suramina e o GX15-070 são inibidores que perturbam as interacções proteína-proteína. Ao impedir que o DDX40 interaja com os seus parceiros proteicos ou de ARN necessários, estes compostos podem inibir a função de helicase do DDX40. Esta perturbação das interacções essenciais para a atividade do DDX40 pode resultar numa diminuição da sua capacidade de modular as estruturas de ARN e influenciar o metabolismo do ARN.