Os inibidores químicos da ADAT2 podem ser seleccionados com base na sua capacidade de perturbar processos celulares essenciais para a função da proteína. O azul de metileno, ao inibir a óxido nítrico sintase, pode diminuir os níveis de óxido nítrico nas células, o que, por sua vez, pode afetar o metabolismo do ARN e inibir indiretamente o papel do ADAT2 na modificação do ARNt. O acetato de chumbo pode inibir o ADAT2 ligando-se aos seus iões metálicos essenciais, enquanto o arsenito de sódio pode inibir enzimas com resíduos críticos de cisteína, que, se presentes no ADAT2, prejudicariam a sua função. A cloroquina altera o pH dos compartimentos intracelulares, como os lisossomas, podendo perturbar o tráfico ou a degradação da ADAT2. A brefeldina A tem como alvo o tráfico de proteínas entre o retículo endoplasmático e o Golgi e, se o ADAT2 necessitar desta via para o seu correto dobramento ou maturação, a sua função ficará comprometida.
Por outro lado, a 3-Metiladenina inibe a autofagia, um processo que poderia degradar a ADAT2 em determinadas condições, levando à acumulação de formas possivelmente não funcionais da proteína. A MG132 bloqueia a degradação proteasómica, uma via que pode regular a renovação da ADAT2, resultando na acumulação de uma proteína ADAT2 defeituosa. Compostos como a cicloheximida e a puromicina interrompem a síntese proteica, o que impediria a reposição dos níveis de ADAT2 na célula, inibindo assim indiretamente a sua atividade. A actinomicina D e a α-manitina inibem a síntese de ARN, o que poderia reduzir a disponibilidade de substratos de ARNt necessários para as funções de modificação do ADAT2, limitando essencialmente a sua atividade ao privá-lo dos seus substratos. Por último, a camptotecina perturba os processos de replicação do ADN, conduzindo a um ambiente celular menos propício à síntese proteica, incluindo a síntese do ADAT2, diminuindo assim a presença funcional do ADAT2 na célula.
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