T6BP CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-404858

Übersicht

TAX1BP1 kodiert T6BP, ein Adapterprotein, das ubiquitinabhängige Signalübertragung an der Schnittstelle von angeborener Immunität, Entzündungskontrolle und selektiver Autophagie koordiniert. T6BP bindet Ubiquitinketten und interagiert mit Partnern wie A20/TNFAIP3 und TRAF-Proteinen, um die NF-κB-Signalgebung nachgeschaltet an Rezeptoren wie TNFR und Toll-like-Rezeptoren zu modulieren und so Zytokin- und antivirale Antworten feinzujustieren. Es ist außerdem an der autophagischen Verarbeitung ubiquitinierter Fracht sowie an Qualitätskontrollwegen beteiligt, die die zelluläre Stresstoleranz und das Überleben beeinflussen. Eine Fehlregulation von TAX1BP1-assoziierten Signalwegen und der Proteostase wurde mit entzündlichen Phänotypen und krebsrelevanten Signalwegen in Verbindung gebracht, was das Protein zu einem nützlichen Knotenpunkt für mechanistische Studien zur Immunregulation und Ubiquitin-Signalgebung macht.

Das T6BP CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des TAX1BP1-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des TAX1BP1-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von TAX1BP1 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die T6BP-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von TAX1BP1-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der T6BP-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf TAX1BP1-Exone abzielen, die für die T6BP-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere TAX1BP1-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom T6BP CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom T6BP CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des TAX1BP1-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das T6BP HDR-Plasmid (h) und T6BP HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von TAX1BP1-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten TAX1BP1-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.