Sox-1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-401473

Übersicht

SOX1 kodiert den Transkriptionsfaktor Sox-1, ein Mitglied der SOXB1-Familie, das besonders stark im Neuroektoderm und in Populationen neuraler Vorläuferzellen exprimiert wird. Sox-1 bindet über seine HMG-Box-Domäne an DNA und reguliert Genprogramme, die die neurale Spezifikation, die Aufrechterhaltung von Vorläuferzellen und das zeitliche Auftreten der Differenzierung steuern; dabei interagiert es mit entwicklungsbiologischen Signalwegen und Netzwerken der Chromatinregulation. In zellulären Signalwegen trägt SOX1 zu transkriptionellen Schaltkreisen bei, die Neurogenese und Linienrestriktion koordinieren, einschließlich Crosstalk mit Notch-, Wnt- und SHH-assoziierten Musterbildungsprozessen. Eine fehlregulierte SOX1-Expression wurde mit aberranten Entwicklungszuständen in Verbindung gebracht und wird u. a. in Kontexten wie Tumoren der neuralen Linie sowie autoantikörperassoziierten neurologischen Syndromen untersucht, was SOX1 zu einem nützlichen Knotenpunkt für mechanistische Forschung macht.

Das Sox-1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des SOX1-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des SOX1-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von SOX1 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die Sox-1-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von SOX1-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der Sox-1-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf SOX1-Exone abzielen, die für die Sox-1-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere SOX1-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom Sox-1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom Sox-1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des SOX1-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das Sox-1 HDR-Plasmid (h) und Sox-1 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von SOX1-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten SOX1-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.