Sox-1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-401473

概要

SOX1は転写因子Sox-1をコードしており、神経外胚葉および神経前駆細胞集団で顕著に発現するSOXB1ファミリーの一員です。Sox-1はHMGボックスドメインを介してDNAに結合し、神経の規定、前駆細胞の維持、分化のタイミングを制御する遺伝子プログラムを調節するとともに、発生シグナル伝達やクロマチン制御ネットワークと相互作用します。細胞内経路においては、SOX1は神経新生と系譜制限を協調させる転写回路に関与し、Notch、Wnt、SHHに関連したパターニング過程とのクロストークも含まれます。SOX1発現の異常は発生状態の破綻と関連づけられており、神経系の系譜腫瘍や自己抗体関連の神経症候群などの文脈で研究されていることから、機序解明研究に有用なノードとなっています。

Sox-1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるSOX1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、SOX1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、SOX1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、Sox-1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、Sox-1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、SOX1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• Sox-1の機能に不可欠なSOX1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、SOX1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• Sox-1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびSox-1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、SOX1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  Sox-1 HDRプラスミド（h）および Sox-1 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはSOX1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のSOX1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。