IFN-α6 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m): sc-421043

Übersicht

Das murine Ifna6-Gen kodiert Interferon-α6 (IFN-α6), ein Typ-I-Interferon, das als Reaktion auf pathogen- und schädigungsassoziierte Signale antivirale und immunmodulatorische Programme einleitet. IFN-α6 bindet an IFNAR und aktiviert die JAK-STAT-Signalübertragung, wodurch interferon-stimulierte Gene induziert werden, die die angeborene Immunabwehr, die Antigenpräsentation und Zytokinnetzwerke regulieren. Dieser Signalweg beeinflusst zelluläre Prozesse wie die Kontrolle der Proliferation und Apoptose und überschneidet sich mit der Signalgebung von Mustererkennungsrezeptoren, einschließlich der RIG-I/MDA5- und TLR-Signalwege. Eine fehlregulierte Typ-I-Interferon-Signalgebung wird mit einer erhöhten Anfälligkeit für Virusinfektionen sowie mit chronisch entzündlichen und autoimmunähnlichen Phänotypen in Verbindung gebracht, wodurch Ifna6 für mechanistische Studien interferongetriebener Pathologien relevant ist.

Das IFN-α6 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des Ifna6-Gens in mouse-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des Ifna6-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von Ifna6 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die IFN-α6-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von Ifna6-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der IFN-α6-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf Ifna6-Exone abzielen, die für die IFN-α6-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere Ifna6-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom IFN-α6 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) und vom IFN-α6 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des Ifna6-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das IFN-α6 HDR-Plasmid (m) und IFN-α6 HDR-Plasmid (m2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von Ifna6-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten Ifna6-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.