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HNF-6CRISPR激活质粒(h) | sc-401082-ACT | 20 µg | $397.00 |
ONECUT1 编码转录因子 HNF-6,这是一种同源结构域蛋白,在内胚层发育以及成年上皮组织稳态维持过程中,统筹并驱动组织特异性的基因表达程序。在人类细胞中,HNF-6 整合来自启动子与增强子的调控输入,以控制谱系决定与分化通路;它在肝脏与胰腺的转录网络以及上皮形态发生中发挥重要作用。通过调节代谢、分泌及细胞身份相关基因的表达,ONECUT1 影响器官发生、细胞命运维持以及应激反应相关的转录调控等过程。ONECUT1/HNF-6 活性失调与代谢性及上皮相关疾病背景下观察到的分化状态改变和转录网络重塑有关,这也支持其作为研究基因调控回路机制的重要节点。
HNF-6 CRISPR激活质粒(h)提供了一种靶向、非破坏性的方法,可在不改变底层DNA序列的情况下上调内源性ONECUT1的表达。
HNF-6 CRISPR激活质粒(h)是一个由三条质粒组成的协同激活介导(SAM)系统,旨在对人类细胞系中的ONECUT1基因座进行高效、位点特异性的转录上调。该系统以一种携带两个失活突变(D10A 和 N863A)的无催化活性的 Cas9(dCas9)为核心,这些突变消除了核酸酶活性,同时保留了 DNA 结合能力。该 dCas9 与强效转录激活因子 VP64 融合,并与用于筛选的布拉西定抗性基因共同表达。第二个质粒编码MS2-p65-HSF1融合蛋白——这一二级激活复合物与dCas9-VP64协同作用,并携带潮霉素抗性基因。第三个质粒编码靶标特异性20 nt sgRNA,其与两个MS2 RNA适配体融合,这些适配体可将MS2-p65-HSF1复合物招募至激活位点,并携带嘌呤霉素抗性基因。这三个质粒按1:1:1的质量比递送,以确保系统所有组分的平衡表达。
在靶位点组装完成后,SAM复合物结合于ONECUT1转录起始位点上游约200 bp处,VP64、p65和HSF1在此协同作用,招募转录 machinery并驱动内源性HNF-6表达上调。与具有核酸酶活性的Cas9不同, dCas9不会引入双链断裂或修改基因组序列,从而保留了原生的ONECUT1位点,并能够研究内源性位点上依赖于HNF-6的转录反应,使其成为功能研究、靶基因鉴定以及在ONECUT1表达被沉默或降低的肿瘤细胞中模拟HNF-6通路恢复的宝贵工具。
仅供研究使用。不用于诊断或治疗。