GATAD1 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-403468

Descripción general

GATAD1 (GATA zinc finger domain containing 1) codifica una proteína nuclear asociada a la cromatina implicada en la regulación transcripcional mediante la unión al ADN y las interacciones proteína–proteína. A través de su dominio de dedo de zinc, GATAD1 se asocia al control de programas de expresión génica que influyen en la proliferación celular, la diferenciación y las respuestas adaptativas al estrés, a menudo en coordinación con modificadores epigenéticos y complejos de remodelación de la cromatina. Se han descrito alteraciones en la expresión o en el número de copias de GATAD1 en múltiples contextos tumorales, lo que respalda el interés por su contribución a estados transcripcionales oncogénicos y a perturbaciones de redes reguladoras a escala genómica. En consecuencia, GATAD1 se estudia con frecuencia en mecanismos de regulación de la cromatina, circuitos de factores de transcripción y el “cross-talk” de vías de señalización relevantes para el cáncer.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO GATAD1 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen GATAD1 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del GATAD1 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de GATAD1 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína GATAD1.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en GATAD1 para la investigación de la señalización de GATAD1, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de GATAD1 críticos para la función de GATAD1
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de GATAD1 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido GATAD1 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido GATAD1 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus GATAD1. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR GATAD1 (h) y el plásmido HDR GATAD1 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología GATAD1 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana GATAD1 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.