SATB2 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (m): sc-431818

Descripción general

Satb2 codifica SATB2, un regulador transcripcional asociado a la matriz nuclear que se une a elementos de ADN ricos en AT y organiza la estructura de la cromatina de orden superior para coordinar programas de expresión génica específicos de linaje en células de ratón. SATB2 influye en redes transcripcionales del desarrollo y en la regulación epigenética, afectando procesos como la diferenciación, el patrón tisular y la maduración neuronal mediante la modulación de la accesibilidad de la cromatina y de las interacciones a larga distancia entre potenciadores y promotores. En el sistema inmunitario y otros tejidos, las proteínas de la familia SATB integran respuestas transcripcionales dependientes de señales al moldear la arquitectura del genoma y el reclutamiento de corregradores. La actividad desregulada de SATB2 se asocia con estados de diferenciación alterados y firmas de expresión génica aberrantes relevantes para fenotipos del desarrollo y la reprogramación transcripcional asociada a enfermedades.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO SATB2 (m) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen Satb2 en líneas celulares mouse. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del Satb2 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de Satb2 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína SATB2.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en Satb2 para la investigación de la señalización de SATB2, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de Satb2 críticos para la función de SATB2
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de Satb2 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido SATB2 CRISPR/Cas9 KO (m) y el plásmido SATB2 CRISPR/Cas9 KO (m2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus Satb2. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR SATB2 (m) y el plásmido HDR SATB2 (m2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología Satb2 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana Satb2 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.