PARP-2 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (m): sc-419019
- Especies Diana: mouse
- 20 µg de plásmido de ADN purificado listo para la trasfección; suficiente para 20 transfecciones máximo
- PARP-2 El plásmido CRISPR/Cas9 Knockout (KO) (m) es un conjunto de plásmidos, cada uno de los cuales codifica la nucleasa Cas9 y un ARN guía (gRNA) de 20 nt específico para el objetivo, diseñado para lograr la máxima eficiencia de knockout utilizando secuencias derivadas de la biblioteca GeCKO v2
- Las secuencias de gRNA dirigen a Cas9 para que induzca roturas de doble cadena (DSB) específicas en el locus genómico PARP-2, lo que da lugar a la inactivación del gen mediante unión de extremos no homólogos (NHEJ)
- Se recomienda el plásmido HDR PARP-2 (m) (sc-419019-HDR) para la cotransfección con el plásmido CRISPR/Cas9 KO PARP-2 (m) a fin de permitir la selección de células editadas con éxito mediante la integración mediada por HDR de un casete de resistencia a la puromicina y un gen reportero RFP
- El plásmido HDR PARP-2 (m) es un conjunto de plásmidos, cada uno de los cuales contiene una plantilla de reparación dirigida por homología (HDR) correspondiente a los sitios diana del ARN guía (gRNA) en el plásmido CRISPR/Cas9 KO PARP-2 (m)
- Cada plásmido HDR contiene dos brazos de homología de ~800 pb que flanquean los casetes de resistencia a la puromicina y RFP, diseñados para unirse a secuencias de ADN genómico que rodean el sitio de rotura de doble cadena inducida por Cas9 y facilitar la integración precisa mediada por HDR
- Los genes de resistencia a la puromicina y RFP están flanqueados por sitios LoxP, lo que permite la eliminación de los marcadores de selección mediante la recombinasa Cre (Vector Cre: sc-418923) tras el establecimiento de líneas celulares knockout estables
- Tras la transfección, la eficacia del knockout puede comprobarse mediante WB, IF ó IHC utilzando el anticuerpo: PARP-2 Anticuerpo (F-8): sc-393343
Información sobre pedidos
| Nombre del producto | Número de catálogo | UNIDAD | Precio | CANTIDAD | Favoritos | |
PARP-2 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (m) | sc-419019 | 20 µg | $397.00 | |||
PARP-2 Plásmido HDR (m) | sc-419019-HDR | 20 µg | $445.00 |
Descripción general
Parp2 codifica la poli(ADP-ribosa) polimerasa 2 (PARP-2), un sensor de daño en el ADN y una ADP-ribosiltransferasa que coopera con PARP-1 para catalizar la poli(ADP-ribosil)ación en sitios de roturas de cadena sencilla. PARP-2 participa en la reparación por escisión de bases y en la remodelación de la cromatina al coordinar el reclutamiento de factores de reparación, modular la dinámica de los nucleosomas e influir en las respuestas al estrés asociadas a la replicación. A través de estas actividades, PARP-2 contribuye al mantenimiento de la estabilidad genómica y puede afectar la progresión del ciclo celular y las decisiones sobre el destino celular inducidas por el estrés. La desregulación de la señalización de PARP y las vías defectuosas de reparación del ADN son ampliamente relevantes para los mecanismos subyacentes a la tumorogénesis, la neurodegeneración y la fisiopatología inflamatoria en sistemas experimentales.
El plásmido CRISPR/Cas9 KO PARP-2 (m) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción selectiva del gen Parp2 en líneas celulares mouse. Cada plásmido del conjunto coexpresa un ARN guía específico (sgRNA) único, dirigido a un sitio distinto dentro del locus Parp2, junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes, y codifica GFP para permitir la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito. Esta estrategia multiguía aumenta la probabilidad de inducir desplazamientos de marco de lectura o deleciones que produzcan una inactivación funcional, ofreciendo una alternativa más robusta a los enfoques de guía única. Las DSB inducidas en múltiples sitios se resuelven mediante unión de extremos no homólogos (NHEJ) o, cuando se utiliza con la plantilla donante HDR incluida, mediante reparación dirigida por homología (HDR) en un sitio diana definido dentro del locus.
Cuando se utiliza junto con el donante HDR que expresa RFP, la fluorescencia de GFP y RFP puede utilizarse conjuntamente para distinguir las poblaciones de células transfectadas de las editadas, lo que agiliza los flujos de trabajo de clasificación y selección de clones basados en citometría de flujo.
Donante de reparación dirigida por homología (HDR) — Casete de puromicina con reportero RFP
Para aplicaciones que requieren clones knockout confirmados y seleccionables, el plásmido HDR PARP-2 (m) incluye un constructo donante HDR que contiene un casete de resistencia a la puromicina (PuroR) y un reportero de proteína fluorescente roja (RFP), flanqueado por brazos de homología específicos de un sitio diana definido Parp2.
Cuando se cotransfecciona con el plásmido PARP-2 CRISPR/Cas9 KO (m):
- El casete PuroR-RFP se integra en el sitio de corte de Cas9 mediante HDR, interrumpiendo el marco de lectura abierto Parp2.
La fluorescencia de la RFP proporciona un indicador visual inmediato del éxito de la integración, lo que permite la identificación o clasificación basada en la fluorescencia de las células editadas antes o junto con la selección con puromicina.
Las células editadas con éxito se confirman mediante la resistencia a la puromicina, lo que reduce sustancialmente la carga de cribado de clones.
Esta estrategia de selección es ideal para generar líneas celulares KO clonales estables para estudios funcionales posteriores, cribado de fármacos o desarrollo de modelos.
Sistema de eliminación del casete Cre-lox
La construcción donante HDR cuenta con sitios loxP que flanquean el casete de selección PuroR-RFP para permitir la eliminación limpia del marcador tras la confirmación del clon. La expresión transitoria de la recombinasa Cre a través del vector Cre: sc-418923 incluido extirpa el casete, dejando un sitio loxP residual mínimo dentro del locus Parp2 y eliminando posibles efectos de confusión en los ensayos posteriores.
Este enfoque en dos pasos:
- Minimiza la alteración de la arquitectura local de la cromatina y de los elementos reguladores vecinos
Restaura un contexto genómico casi nativo en el locus editado
Permite reutilizar la estrategia de selección con puromicina en la misma línea celular para ediciones adicionales
Características principales
- gRNA dirigido a los exones Parp2 críticos para la función PARP-2
Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para una administración simplificada
Donante HDR con resistencia a la puromicina para la selección positiva de clones
Casete PuroR flanqueado por loxP con vector de recombinasa Cre para la eliminación sin fisuras del marcador
Se suministra listo para su uso mediante transfección
Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.