Nkx-6.3 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-407505

Übersicht

NKX6-3 kodiert den Homeobox-Transkriptionsfaktor Nkx-6.3, einen sequenzspezifischen, DNA-bindenden Regulator, der an Programmen der epithelialen Differenzierung und an der Aufrechterhaltung der regionalen Identität in Geweben des Gastrointestinaltrakts beteiligt ist. Als nukleärer Faktor trägt Nkx-6.3 zur Ausprägung transkriptioneller Netzwerke bei, die Linienfestlegung, Proliferation und Reifung steuern, und ist in übergeordnete Entwicklungs- und Zellschicksalspfadwege eingebunden, einschließlich Cross-Talk mit Wnt/β-Catenin und anderen differenzierungsassoziierten Signalkaskaden. Eine veränderte NKX6-3-Expression oder regulatorische Aktivität wurde mit gestörter Schleimhauthomöostase in Verbindung gebracht und in Studien zur gastrointestinalen Pathologie beschrieben, was seine Relevanz in Modellen epithelialer Dysfunktion und krankheitsassoziierter transkriptioneller Reprogrammierung unterstreicht.

Das Nkx-6.3 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des NKX6-3-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des NKX6-3-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von NKX6-3 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die Nkx-6.3-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von NKX6-3-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der Nkx-6.3-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf NKX6-3-Exone abzielen, die für die Nkx-6.3-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere NKX6-3-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom Nkx-6.3 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom Nkx-6.3 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des NKX6-3-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das Nkx-6.3 HDR-Plasmid (h) und Nkx-6.3 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von NKX6-3-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten NKX6-3-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.