JMJD5 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-405787

Descripción general

KDM8 codifica la proteína JMJD5, que contiene el dominio Jumonji C, una oxigenasa nuclear implicada en la regulación de la cromatina y el control transcripcional mediante mecanismos asociados a la hidroxilación/desmetilación de lisinas en histonas. JMJD5 se ha relacionado con la progresión del ciclo celular, las respuestas al estrés replicativo y la coordinación de programas de expresión génica que se intersectan con la señalización del daño en el ADN y la adaptación metabólica. A través de estas funciones, JMJD5 puede influir en vías asociadas a la proliferación y en estados epigenéticos que con frecuencia se encuentran alterados en el cáncer y en otros trastornos que implican una dinámica de cromatina desregulada. En consecuencia, KDM8/JMJD5 se estudia ampliamente como un nodo que conecta la regulación epigenética con salidas transcripcionales dependientes del contexto y con la aptitud celular.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO JMJD5 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen KDM8 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del KDM8 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de KDM8 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína JMJD5.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en KDM8 para la investigación de la señalización de JMJD5, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de KDM8 críticos para la función de JMJD5
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de KDM8 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido JMJD5 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido JMJD5 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus KDM8. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR JMJD5 (h) y el plásmido HDR JMJD5 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología KDM8 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana KDM8 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.