Plasmide CRISPR/Cas9 KO GAS41 (m): sc-425664

Présentation

Yeats4 murin code GAS41, un facteur associé à la chromatine contenant un domaine YEATS, qui participe à la régulation transcriptionnelle en reliant les signaux d’acétylation des histones au remodelage de la chromatine. Il a été rapporté que GAS41 s’associe à des complexes de régulation épigénétique, soutenant des programmes d’expression génique dépendants de l’ARN polymérase II qui influencent la progression du cycle cellulaire, la réplication de l’ADN et la stabilité du génome. Par ses rôles dans l’organisation de la chromatine et le contrôle transcriptionnel, Yeats4/GAS41 est pertinent pour l’étude des états transcriptionnels oncogéniques, de l’aneuploïdie et des voies de réponse au stress dans les tissus prolifératifs. La dérégulation des lecteurs de chromatine de la famille YEATS a été associée à une activité des enhancers modifiée et à une expression génique liée à la transformation, ce qui fait de Yeats4 un nœud utile pour la recherche mécanistique en cancérologie et en biologie du développement.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO GAS41 (m) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène Yeats4 dans les lignées cellulaires mouse. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du Yeats4, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert Yeats4 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine GAS41.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en Yeats4 pour l'étude de la signalisation de GAS41, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de Yeats4 essentiels à la fonction de GAS41
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de Yeats4 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le GAS41 plasmide CRISPR/Cas9 KO (m) et le GAS41 plasmide CRISPR/Cas9 KO (m2) ciblent des sites distincts au sein du locus Yeats4. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le GAS41 plasmide HDR (m) et le GAS41 (m2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie Yeats4 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles Yeats4 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.