COL15A1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-404027

概要

COL15A1は、基底膜および細胞周囲の細胞外マトリックスに局在する非線維性コラーゲンであるコラーゲンXV α1鎖をコードしており、組織構築と細胞―マトリックス間コミュニケーションを支えます。細胞外マトリックスの組み立てやリモデリングに寄与することで、COL15A1は接着、遊走、メカノトランスダクションといったプログラムに影響を与え、インテグリン/FAKシグナル伝達や、マトリックスによって制御される増殖因子の利用可能性とも交差します。COL15A1の発現異常は、間質の構造変化、血管新生ニッチの挙動の変化、侵襲性表現型などと関連しており、がん生物学や血管関連病変を含む複数の疾患状況で観察されています。細胞外マトリックス構成要素として、COL15A1は上皮細胞および内皮細胞の挙動を微小環境から制御する役割という観点で、しばしば研究対象となっています。

COL15A1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるCOL15A1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、COL15A1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、COL15A1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、COL15A1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、COL15A1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、COL15A1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• COL15A1の機能に不可欠なCOL15A1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、COL15A1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• COL15A1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびCOL15A1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、COL15A1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  COL15A1 HDRプラスミド（h）および COL15A1 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはCOL15A1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のCOL15A1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。