Caper CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-416921

概要

RBM39は、ヒトのRNA結合タンパク質Caperをコードしており、スプライソソーム構成因子や転写共役因子との相互作用を介して、転写とpre-mRNAプロセシングを連結させる核内スプライシング因子です。Caperは、選択的スプライシングの決定やRNA代謝プログラムに関与し、細胞周期の進行、分化、ならびにストレス応答性遺伝子発現の制御に影響を与えます。RBM39活性の破綻や異常なスプライシングパターンは、複数の腫瘍状況において、がん原性シグナルの出力やプロテオーム組成の変化と関連付けられています。そのためRBM39は、スプライソソーム機能とシグナル経路の再配線、さらに疾患関連表現型を駆動するRNA依存的機構を結び付けて理解するための研究対象として、しばしば解析されています。

Caper CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるRBM39遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、RBM39内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、RBM39のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、Caperタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、Caperシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、RBM39欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• Caperの機能に不可欠なRBM39エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、RBM39ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• Caper CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびCaper CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、RBM39遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  Caper HDRプラスミド（h）および Caper HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはRBM39ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のRBM39標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。