このシナリオでは、TMCO5B活性化因子の開発は、タンパク質の構造と生物学的役割を包括的に理解することから始まる。X線結晶構造解析、NMR分光法、クライオ電子顕微鏡法などの技術を用いてタンパク質の3次元形状を解明し、活性化物質との結合部位を明らかにする。これらの部位は、タンパク質の活性部位やアロステリック部位に位置する可能性がある。これらの知見により、TMCO5Bに結合して活性化する分子を設計するための標的アプローチが可能になる。
活性化因子の候補が合成されたら、TMCO5Bの活性を増加させる能力を評価するために、一連のハイスループットスクリーニングアッセイを行う。これらのアッセイは、TMCO5Bの確立された役割に応じて、結合親和性、触媒速度、タンパク質間相互作用など、タンパク質機能の様々な側面を測定する。これらのスクリーニングから得られたヒット化合物は、TMCO5Bの活性化因子としての特異性と効力を高めることを目的とした化学修飾を繰り返すことによって最適化される。これには、活性化剤の分子構造を改良して性能を向上させるための設計、合成、試験のサイクルが含まれる。化学者は、活性剤とTMCO5Bとの相互作用を改善するために、官能基や全体的な分子骨格を変えるかもしれないし、溶解性や安定性などの特性も考慮するかもしれない。このようなプロセスを経て、他の細胞成分に影響を与えることなく、TMCO5Bタンパク質の本来の活性を増強するような相互作用ができるように調整された化合物が次々と生み出されることになる。
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| 製品名 | CAS # | カタログ # | 数量 | 価格 | 引用文献 | レーティング |
|---|---|---|---|---|---|---|
Dexamethasone | 50-02-2 | sc-29059 sc-29059B sc-29059A | 100 mg 1 g 5 g | $91.00 $139.00 $374.00 | 36 | |
グルココルチコイドは、グルココルチコイド受容体の活性化を通じて遺伝子発現を制御することができ、TMCO5Bに影響を与える可能性がある。 | ||||||
Thapsigargin | 67526-95-8 | sc-24017 sc-24017A | 1 mg 5 mg | $136.00 $446.00 | 114 | |
様々な遺伝子の発現を変化させるアンフォールドタンパク質反応につながる小胞体ストレスを誘導する。 | ||||||
Isoproterenol Hydrochloride | 51-30-9 | sc-202188 sc-202188A | 100 mg 500 mg | $28.00 $38.00 | 5 | |
βアドレナリン作動薬で、受容体に結合した後、cAMP経路を介して遺伝子発現をアップレギュレートする可能性がある。 | ||||||
PMA | 16561-29-8 | sc-3576 sc-3576A sc-3576B sc-3576C sc-3576D | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg 100 mg | $41.00 $132.00 $214.00 $500.00 $948.00 | 119 | |
プロテインキナーゼCを活性化し、遺伝子転写に影響を及ぼすシグナル伝達のカスケードを引き起こす。 | ||||||
Tunicamycin | 11089-65-9 | sc-3506A sc-3506 | 5 mg 10 mg | $172.00 $305.00 | 66 | |
N-結合型グリコシル化を阻害することでERストレスを誘導し、様々な遺伝子発現経路に影響を及ぼす可能性がある。 | ||||||
U-0126 | 109511-58-2 | sc-222395 sc-222395A | 1 mg 5 mg | $64.00 $246.00 | 136 | |
特にMEKを阻害し、MAPK/ERKシグナル伝達経路を変化させ、遺伝子発現に影響を及ぼす可能性がある。 | ||||||
Etoposide (VP-16) | 33419-42-0 | sc-3512B sc-3512 sc-3512A | 10 mg 100 mg 500 mg | $51.00 $231.00 $523.00 | 63 | |
トポイソメラーゼII阻害剤で、DNA損傷を引き起こし、DNA損傷応答の一部として遺伝子発現に影響を与える。 | ||||||
SP600125 | 129-56-6 | sc-200635 sc-200635A | 10 mg 50 mg | $40.00 $150.00 | 257 | |
JNKシグナルを阻害し、転写因子の活性や遺伝子発現を変化させる可能性がある。 | ||||||
SB 203580 | 152121-47-6 | sc-3533 sc-3533A | 1 mg 5 mg | $90.00 $349.00 | 284 | |
p38 MAPK阻害剤で、炎症反応遺伝子を調節することができ、遺伝子発現に対してより広範な影響を及ぼす可能性がある。 | ||||||
Dimethyloxaloylglycine (DMOG) | 89464-63-1 | sc-200755 sc-200755A sc-200755B sc-200755C | 10 mg 50 mg 100 mg 500 mg | $84.00 $301.00 $374.00 $779.00 | 25 | |
プロリルヒドロキシラーゼを阻害し、HIF-1αを安定化させ、低酸素条件下での遺伝子発現に影響を及ぼす可能性がある。 | ||||||