チアミン三リン酸酵素(THTPA)の化学的阻害剤には、葉酸代謝や、THTPAが生成を助けるチアミンの活性型であるチアミンピロリン酸(TPP)に依存する細胞プロセスを阻害する様々な化合物が含まれる。メトトレキサート、アミノプテリン、プララトレキサートは、葉酸合成に重要な酵素であるジヒドロ葉酸還元酵素(DHFR)の阻害剤である。DHFRを阻害することにより、これらの化学物質は葉酸誘導体の産生を減少させ、その結果、TPPに対する細胞の需要を減少させる。TPPの需要が減るということは、THTPAの酵素活性の必要性が減るということであり、細胞内での役割が減少する。同様に、ラルティトレキセドとペメトレキセドはチミジル酸合成酵素や他の葉酸依存性酵素を標的とし、葉酸補因子に依存するDNA合成に必要なヌクレオチドであるチミジン一リン酸(TMP)の減少をもたらす。ラルティトレキセドやペメトレキセドによるこれらの経路の阻害も、TPPに対する細胞の必要性が減少し、THTPAの活性が低下することを示唆している。
5-フルオロウラシルのような他の阻害剤は、チミジル酸合成酵素を阻害するフルオロデオキシウリジン一リン酸(FdUMP)のような代謝物を産生し、DNA合成に影響を与え、その結果、TPPに関連したプロセスの需要を減少させる。トリメトプリムとピリメタミンは、主に細菌や寄生虫のDHFRに作用するが、ヒトのDHFRにも間接的に作用していると考えることができる。この作用は、同様に葉酸プールの減少を示唆し、したがってTPPとTHTPA活性に対する需要の低下を示唆するであろう。スルファメトキサゾールやトリアムテレンのような薬剤は、葉酸合成酵素を直接標的にするわけではないが、葉酸の取り込みや合成を阻害することにより、細胞内の葉酸レベルを低下させ、TPPの必要量を減少させる。最後に、フルオロフェニルアラニンとシクログアニルは、葉酸代謝には直接関係しないが、細胞の代謝活性を低下させ、TPPとTHTPAの触媒活性の必要性を低下させる可能性がある。
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