SMF_Hmgxb3アクチベーターは、SMF_Hmgxb3と呼ばれるタンパク質や遺伝子産物と相互作用するように調整された化合物の一群を示唆する。生化学的な文脈におけるアクチベーターとは、タンパク質に結合してその本来の生物学的機能を高める分子のことである。このような活性化因子を発見し、特徴づけるには、標的タンパク質の構造、制御、細胞内での役割などを十分に理解する必要がある。X線結晶構造解析、核磁気共鳴(NMR)分光法、低温電子顕微鏡法(cryo-EM)などの方法は、タンパク質の三次元構造を解明し、活性化剤分子との結合部位を特定する上で非常に有用である。計算モデリングはこれらの努力を補い、タンパク質の活性部位やアロステリック部位(分子の結合がタンパク質の活性にプラスの影響を与える可能性のある部位)との相互作用を予測することによって、分子の設計と合成を導くだろう。
SMF_Hmgxb3活性化因子の開発におけるその後の段階では、候補化合物の合成に続いて、タンパク質の活性を調節する効力を評価するための厳密な生化学的試験が行われる。これらの試験には、反応速度の変化を観察する酵素動力学実験や、タンパク質と活性化剤候補分子との相互作用の親和性と特異性を決定する表面プラズモン共鳴(SPR)のような結合アッセイが含まれるかもしれない。成功した化合物は、活性化因子としての選択性、効力、全体的な安定性を高めることを目的とした最適化のプロセスを経ることになるだろう。このような化合物は、合成と試験の反復サイクルによって注意深く改良され、Hmgxb3タンパク質の機能を探るための重要なツールとなるだろう。
関連項目
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| 製品名 | CAS # | カタログ # | 数量 | 価格 | 引用文献 | レーティング |
|---|---|---|---|---|---|---|
5-Aza-2′-Deoxycytidine | 2353-33-5 | sc-202424 sc-202424A sc-202424B | 25 mg 100 mg 250 mg | $218.00 $322.00 $426.00 | 7 | |
DNAメチル化酵素阻害剤として、遺伝子プロモーターの脱メチル化につながり、HMG-boxドメインタンパク質をコードする遺伝子を含む遺伝子の発現を増加させる可能性がある。 | ||||||
Suberoylanilide Hydroxamic Acid | 149647-78-9 | sc-220139 sc-220139A | 100 mg 500 mg | $133.00 $275.00 | 37 | |
ボリノスタットはヒストン脱アセチル化酵素阻害剤であり、クロマチン構造を変化させることで様々な遺伝子の転写を促進する可能性がある。 | ||||||
Mithramycin A | 18378-89-7 | sc-200909 | 1 mg | $55.00 | 6 | |
GCリッチなDNA配列に結合し、転写因子や他のDNA結合タンパク質がDNAにアクセスするのを阻害し、HMG-box含有3の発現に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Trichostatin A | 58880-19-6 | sc-3511 sc-3511A sc-3511B sc-3511C sc-3511D | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg 50 mg | $152.00 $479.00 $632.00 $1223.00 $2132.00 | 33 | |
このヒストン脱アセチル化酵素阻害剤は、ヒストンのアセチル化を増加させ、クロマチン状態をより弛緩させ、おそらくHMG-box含有3遺伝子の発現をアップレギュレートすると考えられる。 | ||||||
Disulfiram | 97-77-8 | sc-205654 sc-205654A | 50 g 100 g | $53.00 $89.00 | 7 | |
アセトアルデヒド脱水素酵素を阻害し、細胞内の銅代謝を調節することが知られており、間接的に遺伝子発現に影響を与え、HMG-box含有3型に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Sodium phenylbutyrate | 1716-12-7 | sc-200652 sc-200652A sc-200652B sc-200652C sc-200652D | 1 g 10 g 100 g 1 kg 10 kg | $77.00 $166.00 $622.00 $5004.00 $32783.00 | 43 | |
ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤であり、ヒストンの過アセチル化を引き起こし、HMG-box 3を含む可能性のある遺伝子発現パターンを変化させる。 | ||||||
Genistein | 446-72-0 | sc-3515 sc-3515A sc-3515B sc-3515C sc-3515D sc-3515E sc-3515F | 100 mg 500 mg 1 g 5 g 10 g 25 g 100 g | $45.00 $164.00 $200.00 $402.00 $575.00 $981.00 $2031.00 | 46 | |
ゲニステインはイソフラボンであり、エピジェネティック・モジュレーターとして作用し、DNAのメチル化やヒストンのアセチル化に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Retinoic Acid, all trans | 302-79-4 | sc-200898 sc-200898A sc-200898B sc-200898C | 500 mg 5 g 10 g 100 g | $66.00 $325.00 $587.00 $1018.00 | 28 | |
レチノイン酸は細胞の分化と遺伝子発現に影響を及ぼし、これにはHMG-boxドメインを含む遺伝子の制御が含まれる。 | ||||||
D,L-Sulforaphane | 4478-93-7 | sc-207495A sc-207495B sc-207495C sc-207495 sc-207495E sc-207495D | 5 mg 10 mg 25 mg 1 g 10 g 250 mg | $153.00 $292.00 $489.00 $1325.00 $8465.00 $933.00 | 22 | |
スルフォラファンはエピジェネティックな制御に影響を与え、ヒストンのアセチル化とメチル化を変化させ、HMG-box含有3の発現に影響を与える可能性が示されている。 | ||||||
Curcumin | 458-37-7 | sc-200509 sc-200509A sc-200509B sc-200509C sc-200509D sc-200509F sc-200509E | 1 g 5 g 25 g 100 g 250 g 1 kg 2.5 kg | $37.00 $69.00 $109.00 $218.00 $239.00 $879.00 $1968.00 | 47 | |
クルクミンは様々なシグナル伝達経路を調節し、エピジェネティックな制御に影響を与えることができ、HMG-box含有3を含む遺伝子の発現に変化をもたらす可能性がある。 | ||||||