Pol I/II/III RPB8阻害剤には、様々なメカニズムによってRNAポリメラーゼI、II、IIIのRPB8サブユニットの機能を間接的に阻害することができる様々な化合物が含まれる。これらの阻害剤はRPB8タンパク質とは直接関係しないが、より広範な転写プロセスや、RPB8が役割を果たすRNA合成の特定の段階を阻害することができる。
最初のグループにはRNAポリメラーゼに直接結合する化合物が含まれ、例えばα-アマニチンはRNAポリメラーゼIIを標的とし、ひいてはRPB8サブユニットに影響を及ぼす。同様に、アクチノマイシンDやDRBは、それぞれRNAポリメラーゼのDNAへの結合を阻害したり、転写の開始から伸長への移行を阻害することによって、転写プロセスを妨害する。トリプトライドのような他の化合物は、RNAポリメラーゼIIの他のサブユニットを標的とし、RPB8に間接的な影響を与える。第二のグループは、コルディセピンやシトシンアラビノシドのような化合物で、RNAやDNAに取り込まれ、RNA鎖の伸長を阻害したり、転写に利用可能なDNAテンプレートを減少させるヌクレオシドアナログである。ツニカマイシンのような化合物は、タンパク質の翻訳後修飾に影響を与え、RNAポリメラーゼ複合体の適切な組み立てと機能に影響を与える可能性がある。フラボピリドールとICRF-193は、CDKやトポイソメラーゼIIのような他の細胞酵素を標的とし、これらは適切な転写制御に必要であり、間接的にRPB8の機能に影響を与える。CX-5461はRNAポリメラーゼIに特異的であるが、Pol Iの転写開始複合体を阻害することによってもRPB8に間接的な影響を与える。
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