PHF8 アクチベーター

一般的なPHF8活性化剤には、トリコスタチンA CAS 58880-19-6、ナトリウム酪酸塩 CAS 156-54-7、バルプロ酸 CAS 99-66-1、ヒドロキサム酸スベロイランイルide CAS 149647-78-9、5-アザシチジン CAS 320-67-2などがある。

PHF8活性化剤は、十文字Cドメイン（JmjC）含有脱メチル化酵素ファミリーのメンバーである植物ホメオドメインフィンガータンパク質8（PHF8）を標的とし、その活性を調節する一群の化合物を包含する。PHF8はエピジェネティックな酵素であり、ヒストンタンパク質上の特定のリジン残基、特にヒストンH3リジン9(H3K9me2)とヒストンH4リジン20(H4K20me1)を脱メチル化することにより、クロマチンリモデリングと遺伝子発現制御において極めて重要な役割を果たしている。PHF8によるこれらのメチル化マークの除去は、クロマチン構造を開き、転写機械がDNAによりアクセスできるようにするため、転写活性化と関連している。

化学的活性化剤によるPHF8の活性化は、直接的または間接的な手段で起こる。直接活性化剤はPHF8の触媒JmjCドメインに結合し、その酵素活性を増加させたり、基質特異性を変えたりする可能性がある。それらはヒストン基質へのPHF8の結合を強めたり、酵素を活性コンフォメーションで安定化させたりする。一方、間接的活性化因子は、PHF8の発現を増加させたり、PHF8の活性を制御する細胞内シグナル伝達経路を調節したり、PHF8の脱メチル化酵素活性を抑制するタンパク質の機能を阻害することによって機能するかもしれない。PHF8活性化因子を含む研究は、エピジェネティックな修飾が遺伝子発現にどのように影響するか、また、これらの修飾が分化、発生、ゲノムの完全性の維持などの細胞プロセスにどのような影響を及ぼすかを理解することに特に関心がある。PHF8活性化因子を用いることで、ヒストン脱メチル化の変化が遺伝子の発現に及ぼす影響と、それに続く細胞の表現型への影響を調べることができる。