MBD3L1阻害剤

一般的なMBD3L1阻害剤としては、トリコスタチンA CAS 58880-19-6、5-アザ-2′-デオキシシチジン CAS 2353-33-5、RG 108 CAS 48208-26-0、ミトラマイシンA CAS 18378-89-7、クロロキン CAS 54-05-7が挙げられるが、これらに限定されない。

MBD3L1阻害剤には、MBD3L1がメチル化DNAに結合するために重要なDNAメチル化構造を阻害する様々な化合物が含まれる。Trichostatin AやEntinostatのようなヒストン脱アセチル化酵素阻害剤は、クロマチン構造をリモデリングすることでMBD3L1の機能を間接的に阻害し、メチル化領域にMBD3L1が結合しやすくする。5-アザ-2'-デオキシシチジン、RG108、S-アデノシルホモシステインなどのDNAメチル化酵素阻害剤は、DNAのメチル化レベルを低下させ、その結果、MBD3L1が利用できる結合部位を減少させ、その機能的活性を阻害する。これらの薬剤は、エピジェネティックマークを変化させることにより、MBD3L1の従来の操作環境に挑戦し、その典型的な結合と制御の役割が損なわれる状態を作り出す。

GCリッチ配列に結合するMithramycin AやDNAにインターカレートするChloroquineのような化合物の作用は、MBD3L1が優先的にメチル化される遺伝子座と相互作用する能力を妨げるDNAの構造変化につながる可能性がある。BIX-01294のようなヒストンメチル化を標的とする阻害剤は、MBD3L1がその機能を発揮すると思われる部位のヒストン修飾パターンを変化させる可能性があり、その結果、MBD3L1の作用のエピジェネティックな文脈を変化させることによって間接的にMBD3L1を阻害することになる。同様に、DNAメチル化酵素を阻害するケルセチンのようなフラボノイドや、デシタビンやゼブラリンのようなメチル化阻害剤も、DNAのメチル化状態を低下させることでMBD3L1を阻害することができる。