HMGI-C阻害剤

一般的なHMGI-C阻害剤には、クロモマイシンA3 CAS 7059-24-7、ミスラマイシンA CAS 18378-89-7、トリコ オスタチン A CAS 58880-19-6、ナトリウム酪酸塩 CAS 156-54-7、2-デオキシ-D-グルコース CAS 154-17-6。

HMGI-C阻害剤は、HMGI-Cタンパク質がDNAと相互作用し、クロマチン構造を変化させ、発現レベルに影響を及ぼす能力を阻害すると仮定されている一群の化学薬剤を包含する。これらの阻害剤は、DNAにインターカレートするか、あるいはHMGI-Cの結合に立体障害を与えるような化合物によって、DNAのマイナーグルーブにあるATリッチ領域を認識するHMGI-CのDNA結合能を標的とすることができる。クロモマイシンA3やミトラマイシンAのような薬剤はGCリッチ配列に結合することができるが、ジスタマイシンのような薬剤は短溝を標的とし、HMGI-Cが転写調節における役割に不可欠な典型的なゲノム相互作用を確立するのを阻害する。

HMGI-Cの機能を阻害するもう一つのアプローチは、クロマチン構造の調節である。トリコスタチンAや酪酸ナトリウムのようなヒストン脱アセチル化酵素（HDAC）阻害剤は、ヒストンのアセチル化レベルを上昇させ、その結果、HMGI-CのDNA結合親和性を低下させる、よりオープンなクロマチン構造をもたらす。その上、2-デオキシグルコースのようないくつかの阻害剤は、細胞代謝を調節することによってその効果を発揮し、間接的にHMGI-Cの発現レベルに影響を与える可能性がある。また、エトポシドやカンプトテシンのようなトポイソメラーゼ阻害剤は、クロマチンランドスケープを変化させ、HMGI-CとDNA間の相互作用動態に影響を与える。このような多様な化学的阻害剤は、それぞれ異なる分子機構を介して作用するが、HMGI-Cの正常な機能を、このタンパク質が作用する構造的・制御的状況に影響を与えることによって変化させるという前提に収束する。