EXOSC1活性化剤とは、EXOSC1(エクソソーム構成要素1)を直接標的とするわけではないが、RNAエクソソーム複合体の中で間接的にその活性に影響を与えることができる化合物のカテゴリーを指す。RNAエクソソームは、真核細胞におけるRNAのプロセシング、分解、品質管理を担うマルチサブユニット複合体である。EXOSC1はこの複合体の重要な構成要素であり、その機能は、適切なRNA代謝を保証するために厳密に制御されている。この化合物はDNAに結合することでRNA合成を阻害し、転写の開始を妨げる。アクチノマイシンDは、RNA基質の産生を減少させることにより、間接的にRNAエクソソーム複合体の仕事量に影響を与え、EXOSC1や他のエクソソーム構成成分に対するRNA処理と分解の要求が高まる可能性がある。同様に、アデノシンアナログであるコルディセピンは、転写中にRNAに取り込まれ、早期終結を引き起こす可能性がある。この結果、エクソソーム複合体によるプロセシングを必要とするRNA基質が変化し、RNA分解要求の増大に応じてEXOSC1活性が亢進する可能性がある。
もう一つのアプローチは、RNA合成を阻害する5-フルオロウラシルのようなヌクレオシドアナログを用いることである。この化合物は、RNA合成を阻害することで、RNAエクソソーム複合体の活性とEXOSC1に間接的な影響を与えることができる。さらに、α-アマニチンのようなRNAポリメラーゼの阻害剤は、RNAエクソソーム複合体のためのRNA基質の生産を減少させ、プロセシングとターンオーバーを必要とするRNA分子のプールを変化させることによって、間接的にEXOSC1に影響を与える可能性がある。プロテアソーム阻害剤であるMG-132は、RNAの安定性を調節し、RNAのターンオーバー、ひいてはEXOSC1の機能に影響を及ぼす可能性がある。核外輸送阻害剤であるレプトマイシンBは、RNA基質の細胞内局在に影響を与え、EXOSC1を含むRNAエクソソーム複合体へのアクセス性に影響を与える可能性がある。DNA損傷応答を活性化するDNA損傷剤は、間接的にRNAプロセシングと安定性に影響を与え、RNAエクソソーム複合体とEXOSC1に影響を与える可能性がある。ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤であるトリコスタチンAは、クロマチン構造と遺伝子発現パターンを変化させ、間接的にRNAプロセシングとEXOSC1に影響を与える可能性がある。RNA修飾を変化させる化学物質である5-アザシチジンは、RNAエクソソーム複合体とEXOSC1によってプロセシングされるRNA基質のプロセシングと安定性に影響を与える可能性がある。mRNAの翻訳阻害剤であるシクロヘキシミドは、間接的にRNAレベルとターンオーバーに影響を与え、RNAエクソソーム複合体とEXOSC1の機能に影響を与える可能性がある。小干渉RNA(siRNA)やショートヘアピンRNA(shRNA)は、RNAエクソソーム複合体の構成要素をコードする遺伝子を特異的に標的にして発現を低下させ、EXOSC1に影響を与える可能性がある。さらに、RNA分子を安定化させるRNase阻害剤は、RNAエクソソーム複合体によって処理されるRNA基質のターンオーバーに間接的に影響を与え、EXOSC1の機能に影響を与える可能性がある。
製品名 | CAS # | カタログ # | 数量 | 価格 | 引用文献 | レーティング |
---|---|---|---|---|---|---|
Actinomycin D | 50-76-0 | sc-200906 sc-200906A sc-200906B sc-200906C sc-200906D | 5 mg 25 mg 100 mg 1 g 10 g | $73.00 $238.00 $717.00 $2522.00 $21420.00 | 53 | |
アクチノマイシンDは転写阻害剤であり、RNAエクソソーム複合体の基質となるRNAの産生を減少させることで、EXOSC1に間接的に影響を与えることができる。 | ||||||
Cordycepin | 73-03-0 | sc-203902 | 10 mg | $99.00 | 5 | |
コルディセピンはアデノシンアナログであり、転写中にRNAに取り込まれ、RNA合成の早期終了につながる可能性がある。 | ||||||
Fluorouracil | 51-21-8 | sc-29060 sc-29060A | 1 g 5 g | $36.00 $149.00 | 11 | |
5-フルオロウラシルはRNA合成を阻害するヌクレオシド類似体であり、RNA産生を阻害し、RNAエクソソーム複合体やEXOSC1に影響を与える可能性がある。 | ||||||
α-Amanitin | 23109-05-9 | sc-202440 sc-202440A | 1 mg 5 mg | $260.00 $1029.00 | 26 | |
α-アマニチンはRNAポリメラーゼの阻害剤であり、RNAエクソソーム複合体の基質となるRNAの産生を減少させ、間接的にEXOSC1に影響を与える。 | ||||||
MG-132 [Z-Leu- Leu-Leu-CHO] | 133407-82-6 | sc-201270 sc-201270A sc-201270B | 5 mg 25 mg 100 mg | $56.00 $260.00 $980.00 | 163 | |
MG-132はプロテアソーム阻害剤であり、RNAの安定性を調節し、RNAのターンオーバーに影響を与え、間接的にEXOSC1の機能に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Leptomycin B | 87081-35-4 | sc-358688 sc-358688A sc-358688B | 50 µg 500 µg 2.5 mg | $105.00 $408.00 $1224.00 | 35 | |
レプトマイシンBは核外輸送を阻害し、RNA基質の細胞内局在を変化させ、RNAエクソソーム複合体やEXOSC1へのアクセス性に影響を与える。 | ||||||
Trichostatin A | 58880-19-6 | sc-3511 sc-3511A sc-3511B sc-3511C sc-3511D | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg 50 mg | $149.00 $470.00 $620.00 $1199.00 $2090.00 | 33 | |
トリコスタチンAはヒストン脱アセチル化酵素阻害剤で、クロマチン構造と遺伝子発現パターンを変化させ、RNAプロセシングとEXOSC1に間接的に影響を与える可能性がある。 | ||||||
5-Azacytidine | 320-67-2 | sc-221003 | 500 mg | $280.00 | 4 | |
5-アザシチジンはRNA修飾を変化させる化学物質であり、RNAエクソソーム複合体やEXOSC1によって処理されるRNA基質の処理や安定性に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Cycloheximide | 66-81-9 | sc-3508B sc-3508 sc-3508A | 100 mg 1 g 5 g | $40.00 $82.00 $256.00 | 127 | |
シクロヘキシミドはmRNAの翻訳を阻害し、間接的にRNAレベルとターンオーバーに影響を与え、RNAエクソソーム複合体とEXOSC1の機能に影響を与える可能性がある。 |