CCRKの化学的阻害剤は、キナーゼの触媒活性に不可欠なATP結合部位を標的とする。Purvalanol A、Roscovitine、Flavopiridolはすべて強力なCDK阻害剤であり、CCRKの活性部位への結合をATPと競合することによって阻害効果を示す。このATPポケットの占有は、CCRKの基質へのリン酸基の転移を妨げるが、この作用は細胞周期の進行を制御するキナーゼの機能の中心をなすものである。同様に、OlomoucineとIndirubin-3'-monoximeは、この同じATPポケットに結合することによってCCRKに阻害作用を及ぼし、キナーゼを不活性にする。この阻害は、CCRKの活性に重要なリン酸化イベントを直接阻害する。
さらに、ブチロラクトンI、R547、SNS-032、Dinaciclibなどの化合物は、ATP結合を阻害することによってCDKを阻害する能力を持っていることが特徴である。これらの化学的阻害剤はCCRKのATP結合部位に結合し、キナーゼの触媒活性を確実に停止させる。これらの化学物質によるCCRKの阻害は、標的タンパク質のリン酸化を妨げることにより、細胞周期調節におけるその役割に影響を与える。LEE011、Palbociclib、Abemaciclibは、CCRKのキナーゼ活性に重要なATP結合部位を占有することで、同様の作用様式を示す。この占有によって、CCRKの機能を効果的に阻害し、基質をリン酸化する能力を阻害し、その結果、CCRK活性が必要な時点で細胞周期の進行を停止させる。これらの化学物質はそれぞれ、CCRKの酵素活性にとって極めて重要なキナーゼのATPポケットを標的とすることで、CCRKの機能的阻害剤として作用する。
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