Il gruppo di composti chimici noti come inibitori della perossina 1 agisce principalmente attraverso la modulazione del metabolismo lipidico e della proliferazione dei perossisomi. Gli inibitori della HMG-CoA reduttasi, come la Lovastatina, l'Atorvastatina, la Pravastatina, la Simvastatina e la Fluvastatina, riducono la biosintesi del colesterolo, un processo in cui sono coinvolti i perossisomi. La riduzione della biosintesi lipidica può inibire indirettamente l'attività funzionale della perossina 1, coinvolta nella biogenesi dei perossisomi. Pertanto, la diminuzione della richiesta di biogenesi dei perossisomi dovuta alla riduzione della biosintesi lipidica potrebbe portare all'inibizione funzionale della Perossina 1.
D'altra parte, gli agonisti PPARα come il fenofibrato, il gemfibrozil e il clofibrato e gli agonisti PPARγ come il rosiglitazone e il pioglitazone possono aumentare l'espressione dei geni coinvolti nel metabolismo lipidico, portando a un aumento della proliferazione dei perossisomi. Questa maggiore richiesta di perossisomi potrebbe superare la capacità funzionale della perossina 1, portando alla sua inibizione. Anche il clotrimazolo, che inibisce la biosintesi dell'ergosterolo, un processo che avviene in parte nei perossisomi, può portare a una riduzione dell'attività della perossina 1. Analogamente, lo Zileuton, un inibitore della 5-lipossigenasi, può diminuire la produzione di leucotrieni metabolizzati nei perossisomi, determinando una riduzione dell'attività della Perossina 1 dovuta alla diminuzione del fabbisogno di perossisomi.
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