Gli inibitori chimici del METH-2 funzionano attraverso vari meccanismi cellulari per inibire la sua attività. Il triclabendazolo agisce sulla METH-2 colpendo l'enzima fosfoglicerato chinasi, che fa parte della via della glicolisi. Questo porta a una riduzione dei livelli di ATP all'interno della cellula, diminuendo di conseguenza l'energia disponibile per l'attività di METH-2. Il bortezomib agisce in modo diverso, concentrandosi sul proteasoma, un complesso responsabile della degradazione delle proteine marcate dall'ubiquitinazione. L'inibizione del proteasoma determina l'accumulo di proteine che possono includere inibitori di METH-2, portando così indirettamente alla riduzione dell'attività funzionale di METH-2 a causa della presenza dei suoi inibitori. La rapamicina ha un approccio diverso: si lega a FKBP12 per inibire mTOR, una chinasi parte integrante della sintesi proteica e della crescita cellulare. Questa azione può portare a una diminuzione della sintesi delle proteine essenziali per l'attività o la stabilità di mTOR. La ciclosporina A, legandosi alle ciclofiline e inibendo la calcineurina, può alterare lo stato di fosforilazione delle proteine che partecipano all'attivazione o alla stabilizzazione di METH-2, riducendone l'attività.
Inoltre, l'imatinib agisce inibendo la tirosin-chinasi Bcr-Abl, potenzialmente coinvolta nella fosforilazione e nell'attivazione di METH-2. L'inibizione di questa chinasi può essere utile per ridurre l'attività di METH-2. L'inibizione di questa chinasi può quindi portare a una diminuzione dell'attività di METH-2. SB-431542 inibisce specificamente le chinasi simili ai recettori dell'attivina della superfamiglia TGF-β, che possono regolare METH-2, determinando una diminuzione della sua attività. LY294002 ha come bersaglio la fosfatidilinositolo 3-chinasi, che fa parte della via di Akt che può regolare METH-2; inibendo questa chinasi, l'attivazione di METH-2 diminuisce. Gli inibitori di MEK, PD98059 e U0126, potenzialmente diminuiscono l'attività di METH-2 riducendo l'attivazione della via ERK, che può fosforilare e attivare METH-2. Anche l'inibizione della via JNK da parte di SP600125 può determinare una riduzione dell'attivazione di proteine coinvolte nella regolazione della funzione di METH-2. Infine, Sorafenib e ZM-447439 inibiscono varie chinasi, come VEGFR, PDGFR e Aurora chinasi, che possono regolare METH-2 durante diverse vie di segnalazione e la progressione del ciclo cellulare, portando a una diminuzione dell'attività di METH-2.
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