Gli attivatori DDX56 appartengono a una classe di composti chimici che modulano l'attività della proteina DEAD-box elicasi 56 (DDX56). La DDX56 fa parte della famiglia delle proteine DEAD-box, caratterizzata dalla presenza del motivo conservato Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD). Queste proteine sono elicasi putative dell'RNA coinvolte in vari aspetti del metabolismo dell'RNA, tra cui la trascrizione, lo splicing dell'RNA, l'assemblaggio del ribosoma e l'avvio della traduzione. Come attivatori, questi composti interagiscono con DDX56 per potenziare la sua attività di elicasi o la sua interazione con altri componenti molecolari. I meccanismi precisi con cui gli attivatori della DDX56 esercitano il loro effetto sulla proteina possono variare a seconda della struttura molecolare specifica di ciascun composto e del contesto in cui la DDX56 funziona. In genere, l'attivazione può comportare cambiamenti nella conformazione della proteina, la stabilizzazione della proteina in uno stato attivo o la facilitazione delle interazioni proteina-proteina o proteina-RNA che sono essenziali per la funzione dell'elicasi.
Dal punto di vista chimico, gli attivatori di DDX56 possono essere diversi e vanno da piccole molecole organiche a composti biologici più complessi. La loro interazione con DDX56 è altamente specifica, spesso richiede allineamenti molecolari precisi per agganciarsi efficacemente ai siti attivi o allosterici della proteina. Questa specificità è fondamentale per garantire che l'attivazione della DDX56 sia ben regolata e non influisca indiscriminatamente sulla funzione di altre elicasi o proteine cellulari. La progettazione molecolare degli attivatori di DDX56 può essere influenzata dalle caratteristiche strutturali uniche di DDX56, come il suo dominio ATPasi, che è parte integrante dell'attività elicasica, o i suoi domini di legame con l'RNA, che dettano la specificità dell'interazione con il substrato RNA. La comprensione della relazione struttura-attività (SAR) di questi attivatori è essenziale per mettere a punto la loro interazione con DDX56, ottimizzando l'effetto molecolare desiderato e riducendo al minimo le interazioni fuori bersaglio con altri componenti cellulari.
| Nome del prodotto | CAS # | Codice del prodotto | Quantità | Prezzo | CITAZIONI | Valutazione |
|---|---|---|---|---|---|---|
Bisindolylmaleimide I (GF 109203X) | 133052-90-1 | sc-24003A sc-24003 | 1 mg 5 mg | $103.00 $237.00 | 36 | |
La bisindolilmaleimide I, un inibitore della protein chinasi C (PKC), sopprime l'attività della PKC. Il DDX56 è noto per interagire con la PKC e l'inibizione della PKC da parte della Bisindolilmaleimide I può interrompere la segnalazione a valle, portando ad una maggiore attività funzionale del DDX56. | ||||||
Wortmannin | 19545-26-7 | sc-3505 sc-3505A sc-3505B | 1 mg 5 mg 20 mg | $66.00 $219.00 $417.00 | 97 | |
La wortmannina, un inibitore della fosfoinositide 3-chinasi (PI3K), agisce sulla via PI3K-AKT. DDX56 interagisce con i componenti di questo percorso. L'inibizione mediata da Wortmannin di PI3K porta a un aumento dell'attività funzionale di DDX56 interrompendo i segnali inibitori e facilitando la sua attivazione. | ||||||
SB 203580 | 152121-47-6 | sc-3533 sc-3533A | 1 mg 5 mg | $88.00 $342.00 | 284 | |
SB203580, un inibitore della p38 MAP chinasi, influisce sulla via p38 MAPK. La DDX56 è modulata dalla via p38 MAPK e l'inibizione con SB203580 aumenta l'attività della DDX56. Questo composto impedisce la regolazione negativa di DDX56, con conseguente aumento dell'attivazione funzionale attraverso la via p38 MAPK. | ||||||
Trametinib | 871700-17-3 | sc-364639 sc-364639A sc-364639B | 5 mg 10 mg 1 g | $112.00 $163.00 $928.00 | 19 | |
Il trametinib, un inibitore selettivo di MEK, interferisce con la via MAPK/ERK. Il DDX56 è strettamente legato a questa via e il trametinib aumenta l'attività funzionale del DDX56 interrompendo i meccanismi di regolazione negativa all'interno della via MAPK/ERK, con conseguente aumento dell'attivazione del DDX56. | ||||||
SP600125 | 129-56-6 | sc-200635 sc-200635A | 10 mg 50 mg | $40.00 $150.00 | 257 | |
SP600125, un inibitore di JNK, agisce sulla via di segnalazione di JNK. DDX56 è noto per interagire con i componenti della via JNK. L'inibizione da parte di SP600125 aumenta l'attività funzionale di DDX56 prevenendo i loop di feedback negativo all'interno della via JNK, con conseguente aumento dell'attivazione di DDX56. | ||||||
LY 294002 | 154447-36-6 | sc-201426 sc-201426A | 5 mg 25 mg | $121.00 $392.00 | 148 | |
LY294002, un inibitore PI3K, modula il percorso PI3K-AKT. DDX56 interagisce con i componenti di questo percorso. L'inibizione da parte di LY294002 aumenta l'attivazione di DDX56 interrompendo i segnali inibitori all'interno del percorso PI3K-AKT, con conseguente aumento dell'attività funzionale di DDX56. | ||||||
PD 98059 | 167869-21-8 | sc-3532 sc-3532A | 1 mg 5 mg | $39.00 $90.00 | 212 | |
PD98059, un inibitore MEK, influenza il percorso MAPK/ERK. DDX56 è strettamente legato a questo percorso. L'inibizione di PD98059 aumenta l'attività funzionale di DDX56 interrompendo i meccanismi di regolazione negativa all'interno del percorso MAPK/ERK, con conseguente aumento dell'attivazione di DDX56. | ||||||
VX 702 | 745833-23-2 | sc-361400 | 10 mg | $132.00 | 1 | |
Il VX-702, un inibitore della p38 MAP chinasi, interrompe il percorso della p38 MAPK. La DDX56 è modulata dalla via p38 MAPK e l'inibizione da parte di VX-702 aumenta l'attività funzionale della DDX56. Questo composto impedisce la regolazione negativa di DDX56, con conseguente aumento dell'attivazione attraverso la via p38 MAPK. | ||||||
SP2509 | 1423715-09-6 | sc-492604 | 5 mg | $284.00 | ||
SP2509, un inibitore dell'istone metiltransferasi G9a, influenza la regolazione epigenetica. L'espressione di DDX56 può essere controllata epigeneticamente. L'inibizione da parte di SP2509 aumenta l'attività funzionale di DDX56 alterando i marchi epigenetici, con conseguente aumento dell'espressione e successiva attivazione di DDX56. | ||||||