Gli attivatori della DDX58 comprendono una serie di composti chimici che, pur non aumentando direttamente la trascrizione o la traduzione della DDX58, modulano le vie cellulari che portano a un aumento dell'attività della proteina DDX58. Il poli(I:C) e l'RNA 5'-trifosfato sono due di questi composti, il primo è un analogo sintetico del dsRNA e il secondo un modello di RNA virale presente in natura, che si legano entrambi direttamente a DDX58. La classificazione dei composti come attivatori di 2010305A19Rik si riferisce a un gruppo di sostanze chimiche specificamente identificate per la loro capacità di aumentare l'espressione del gene 2010305A19Rik. L'identificazione di tali attivatori inizia in genere con un processo di screening ad alto rendimento (HTS), che prevede l'analisi di vaste librerie di composti chimici per trovare quelli in grado di potenziare l'attività del gene. Questo gene, codificato nel genoma del topo, può svolgere un ruolo in vari processi cellulari e capire come controllarne l'espressione è fondamentale per chiarirne la funzione. Durante lo screening, i composti vengono introdotti in linee cellulari progettate per segnalare l'attività del gene 2010305A19Rik, spesso attraverso un sistema reporter luminescente o fluorescente. I composti in grado di attivare il gene determineranno un aumento del segnale del reporter, che viene misurato con strumenti di rilevazione appropriati. Quelli che determinano un aumento significativo del segnale sono considerati hit e vengono selezionati per un'ulteriore convalida. Un aumento dei livelli di mRNA osservato mediante qPCR è una forte indicazione dell'attivazione del gene a livello trascrizionale. Inoltre, per valutare se l'aumento dell'mRNA si traduce in una maggiore produzione di proteine, si ricorre al Western blotting. Questa tecnica è in grado di rilevare e quantificare il prodotto proteico del gene 2010305A19Rik, fornendo la prova che l'effetto di attivazione del composto si estende all'espressione proteica.
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Nome del prodotto | CAS # | Codice del prodotto | Quantità | Prezzo | CITAZIONI | Valutazione |
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PMA | 16561-29-8 | sc-3576 sc-3576A sc-3576B sc-3576C sc-3576D | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg 100 mg | $40.00 $129.00 $210.00 $490.00 $929.00 | 119 | |
Il PMA è un potente attivatore della proteina chinasi C (PKC), che è coinvolta in varie cascate di segnalazione. L'attivazione della PKC può provocare la fosforilazione di 2010305A19Rik, aumentandone potenzialmente l'attività all'interno del suo percorso. | ||||||
D-erythro-Sphingosine-1-phosphate | 26993-30-6 | sc-201383 sc-201383D sc-201383A sc-201383B sc-201383C | 1 mg 2 mg 5 mg 10 mg 25 mg | $162.00 $316.00 $559.00 $889.00 $1693.00 | 7 | |
La sfingosina-1-fosfato interagisce con i suoi recettori accoppiati a proteine G, provocando eventi di segnalazione intracellulare. Questo può attivare le chinasi a valle che possono fosforilare 2010305A19Rik, migliorando così la sua attività funzionale. | ||||||
Ionomycin | 56092-82-1 | sc-3592 sc-3592A | 1 mg 5 mg | $76.00 $265.00 | 80 | |
La ionomicina è uno ionoforo di calcio che aumenta i livelli di calcio intracellulare, attivando le protein chinasi calcio-dipendenti. Queste chinasi potrebbero poi attivare 2010305A19Rik mediante fosforilazione. | ||||||
A23187 | 52665-69-7 | sc-3591 sc-3591B sc-3591A sc-3591C | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg | $54.00 $128.00 $199.00 $311.00 | 23 | |
L'A23187 è un altro ionoforo di calcio che eleva il Ca2+ intracellulare, che può attivare le protein chinasi calcio/calmodulina-dipendenti. Queste chinasi possono fosforilare e potenzialmente aumentare l'attività di 2010305A19Rik. | ||||||
IBMX | 28822-58-4 | sc-201188 sc-201188B sc-201188A | 200 mg 500 mg 1 g | $159.00 $315.00 $598.00 | 34 | |
L'IBMX è un inibitore non selettivo delle fosfodiesterasi, che impedisce la scomposizione di cAMP e cGMP. Livelli elevati di questi nucleotidi ciclici potrebbero portare all'attivazione di chinasi che potenziano l'attività di 2010305A19Rik. | ||||||
FTY720 | 162359-56-0 | sc-202161 sc-202161A sc-202161B | 1 mg 5 mg 25 mg | $32.00 $75.00 $118.00 | 14 | |
FTY720 è un modulatore del recettore della sfingosina-1-fosfato, che può portare all'attivazione di chinasi a valle. Queste chinasi attivate possono fosforilare e aumentare l'attività di 2010305A19Rik. | ||||||
(−)-Epigallocatechin Gallate | 989-51-5 | sc-200802 sc-200802A sc-200802B sc-200802C sc-200802D sc-200802E | 10 mg 50 mg 100 mg 500 mg 1 g 10 g | $42.00 $72.00 $124.00 $238.00 $520.00 $1234.00 | 11 | |
L'EGCG è un polifenolo in grado di inibire alcune protein-chinasi, riducendo potenzialmente le influenze regolatorie negative su 2010305A19Rik, migliorandone così l'attività per alleggerimento dell'inibizione. | ||||||
LY 294002 | 154447-36-6 | sc-201426 sc-201426A | 5 mg 25 mg | $121.00 $392.00 | 148 | |
LY294002 è un inibitore di PI3K, che può alterare le vie di segnalazione a valle. Inibendo PI3K, può ridurre i segnali inibitori, potenziando indirettamente l'attivazione di 2010305A19Rik attraverso cascate di chinasi. | ||||||
SB 203580 | 152121-47-6 | sc-3533 sc-3533A | 1 mg 5 mg | $88.00 $342.00 | 284 | |
SB203580 è un inibitore specifico di p38 MAPK. Inibendo la p38, potrebbe spostare l'equilibrio della segnalazione cellulare verso i percorsi che attivano 2010305A19Rik, potenziando così indirettamente la sua attività. | ||||||
Genistein | 446-72-0 | sc-3515 sc-3515A sc-3515B sc-3515C sc-3515D sc-3515E sc-3515F | 100 mg 500 mg 1 g 5 g 10 g 25 g 100 g | $26.00 $92.00 $120.00 $310.00 $500.00 $908.00 $1821.00 | 46 | |
La genisteina è un inibitore della tirosina chinasi che può portare a una ridotta inibizione competitiva per le chinasi che potrebbero attivare 2010305A19Rik, aumentando potenzialmente l'attività funzionale della proteina attraverso la fosforilazione. |