Les inhibiteurs de ZFR2 ciblent principalement les processus associés à la synthèse, au traitement et à la modification de l'ARN. Ces molécules ont été choisies sur la base de la compréhension générale de la fonction de ZFR2 en tant que protéine de liaison à l'ARN. Par exemple, l'actinomycine D, l'α-amanitine et le DRB inhibent spécifiquement la synthèse de l'ARN en s'intercalant dans l'ADN ou en inhibant directement l'ARN polymérase II. Ces inhibiteurs interrompent le processus de transcription et peuvent avoir un impact indirect sur des protéines telles que ZFR2, qui ont besoin de molécules d'ARN spécifiques pour se lier et fonctionner.
D'autre part, des produits chimiques comme la Spliceostatine A et le Pladienolide B ciblent directement la machinerie d'épissage de l'ARNm. En inhibant la fonction du spliceosome, ces produits chimiques peuvent affecter le pool de molécules d'ARN avec lesquelles des protéines comme ZFR2 peuvent interagir. L'altération du paysage de l'ARN dans la cellule peut ensuite influencer l'activité de ZFR2. En outre, des composés tels que la cordycépine et la ribavirine sont des analogues de nucléosides qui ont des effets distincts sur le métabolisme de l'ARN. Alors que la cordycépine peut mettre fin à la synthèse de l'ARNm, la ribavirine affecte l'encapsulation de l'ARNm et d'autres processus liés à l'ARN.
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