Les inhibiteurs chimiques de TMCO4 comprennent une variété de composés qui perturbent différents aspects de la fonction cellulaire, en particulier dans le réticulum endoplasmique (RE), où TMCO4 est localisé. L'éraste, par exemple, cible l'antiporteur cystine/glutamate, ce qui entraîne une diminution des niveaux de glutathion intracellulaire et un stress oxydatif subséquent qui peut altérer l'état redox du RE, lequel est essentiel au bon fonctionnement du TMCO4. De même, la thapsigargin et l'acide cyclopiazonique, tous deux inhibiteurs de la pompe SERCA, perturbent l'homéostasie calcique dans le RE, ce qui peut altérer la fonction du TMCO4 en affectant son repliement et sa maturation dans ce compartiment. Le rôle de la tunicamycine dans l'inhibition de la glycosylation liée à l'azote peut également entraîner un repliement et une fonction incorrects du TMCO4 s'il est soumis à cette modification post-traductionnelle. La Brefeldine A complique encore le bon fonctionnement de TMCO4 en perturbant le trafic entre le RE et le Golgi, un processus qui pourrait être nécessaire à la maturation et à la fonction de la protéine.
D'autres composés peuvent altérer la fonction de TMCO4, notamment le MG-132, qui inhibe le protéasome, entraînant une accumulation de protéines mal repliées dans le RE et un stress du RE subséquent qui peut affecter le repliement et la fonction de TMCO4. Le Salubrinal et le Sephin1, qui modulent l'état de phosphorylation de l'eIF2α, peuvent également inhiber indirectement le TMCO4 en modifiant les taux de synthèse des protéines dans des conditions de stress, ce qui affecte l'homéostasie globale des protéines dans le RE. L'inhibition de la dégradation associée au RE (ERAD) par l'eeyarestatine I peut entraîner l'accumulation de TMCO4 mal repliés, tandis que la Ceapin-A7 et le GSK2606414, inhibiteurs de l'ATF6 et de la signalisation PERK respectivement, peuvent avoir un impact sur la réponse aux protéines non repliées (UPR), affectant ainsi potentiellement la fonction de TMCO4. Enfin, l'acide 4-phénylbutyrique agit comme un chaperon chimique, influençant le stress du RE et les environnements de repliement des protéines, qui à leur tour peuvent avoir un impact sur la fonction de TMCO4 dans le RE.
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