Swi1 Activateurs

Les activateurs Swi1 courants comprennent, entre autres, l'acide hydroxamique Suberoylanilide CAS 149647-78-9, la Romidepsine CAS 128517-07-7, la 5-Azacytidine CAS 320-67-2, la 5-Aza-2′-Deoxycytidine CAS 2353-33-5 et le RG 108 CAS 48208-26-0.

L'appellation "activateurs de Swi1" se rapporterait à une classe de produits chimiques qui ciblent et renforcent la fonction de la protéine Swi1, dont on sait qu'elle joue un rôle dans la régulation de la structure de la chromatine et de l'expression des gènes. Swi1 fait partie du complexe SWI/SNF (switch/sucrose non-fermentable), un complexe de remodelage de la chromatine qui est conservé au cours de l'évolution, de la levure à l'homme. Dans le contexte de la régulation des gènes, Swi1 est impliqué dans le remodelage de la chromatine dépendant de l'ATP, qui rend l'ADN plus ou moins accessible aux facteurs de transcription et aux autres protéines qui contrôlent l'expression des gènes. Les activateurs de Swi1 devraient donc renforcer l'activité de remodelage du complexe SWI/SNF, potentiellement en augmentant l'activité ATPase du complexe, en stabilisant le complexe sur la chromatine ou en favorisant l'interaction de Swi1 avec d'autres sous-unités ou facteurs de régulation qui modulent sa fonction.

La compréhension des mécanismes biochimiques et moléculaires par lesquels les activateurs de Swi1 exercent leurs effets impliquerait une approche à multiples facettes. Au niveau biochimique, des essais visant à mesurer l'activité ATPase pourraient révéler comment les activateurs de Swi1 influencent le remodelage de la chromatine en fonction de l'énergie. En outre, des études de liaison utilisant la protéine Swi1 purifiée et des activateurs potentiels pourraient délimiter la dynamique de l'interaction, comme l'affinité des activateurs pour Swi1 et tout changement de conformation induit par la liaison de l'activateur. Au niveau moléculaire, l'impact des activateurs de Swi1 pourrait être évalué en analysant les changements dans l'expression des gènes connus pour être régulés par le complexe SWI/SNF. Des techniques telles que l'immunoprécipitation de la chromatine (ChIP) suivie d'un séquençage pourraient être utilisées pour identifier les régions de la chromatine où Swi1 recrute activement le complexe SWI/SNF en présence de ces activateurs, ce qui permettrait d'avoir une vision à l'échelle du génome de la manière dont l'activation de Swi1 affecte l'architecture de la chromatine et les schémas d'expression génique. Grâce à ces méthodes, le rôle des activateurs de Swi1 dans la modulation de la structure de la chromatine et ses effets ultérieurs sur la régulation des gènes ont pu être élucidés.