Inhibiteurs PRP2

Les inhibiteurs courants de la PRP2 comprennent, entre autres, la Brefeldine A CAS 20350-15-6, la Monensine A CAS 17090-79-8, la Tunicamycine CAS 11089-65-9, le MG-132 [Z-Leu- Leu-Leu-CHO] CAS 133407-82-6 et le Cycloheximide CAS 66-81-9.

Les inhibiteurs de PRP2 représentent une classe chimique qui cible spécifiquement la protéine PRP2, un composant essentiel du spliceosome, un complexe macromoléculaire impliqué dans l'épissage des pré-ARNm. La PRP2, également connue sous le nom de DHX16, est une hélicase ARN ATP-dépendante qui facilite les réarrangements structurels nécessaires à la deuxième étape de l'épissage, au cours de laquelle les exons sont réunis et les introns supprimés. L'inhibition de PRP2 perturbe sa fonction dans ce processus hautement coordonné, ce qui peut entraîner des événements d'épissage altérés ou incomplets. En particulier, l'activité de la PRP2 dépend de sa capacité à hydrolyser l'ATP pour fournir l'énergie nécessaire à l'activité de l'hélicase, qui permet le déroulement et le remodelage des complexes ARN-protéines. Les composés classés comme inhibiteurs de la PRP2 interagissent généralement avec cette protéine en bloquant la liaison de l'ATP ou en interférant avec sa fonction d'hélicase, modulant finalement le traitement de l'ARN au niveau moléculaire. Le mécanisme détaillé de l'inhibition de la PRP2 implique souvent la stabilisation de conformations spécifiques du spliceosome ou la prévention des transitions nécessaires entre différents états structurels au cours du cycle d'épissage. Ces inhibiteurs sont souvent de petites molécules conçues pour cibler le domaine ATPase ou pour interagir avec des résidus clés impliqués dans la liaison à l'ARN. Des études structurales, impliquant souvent la cristallographie aux rayons X ou la cryo-microscopie électronique, ont été utilisées pour cartographier les sites d'interaction entre la PRP2 et ses inhibiteurs. Ces interactions peuvent entraîner un blocage de l'assemblage du spliceosome ou une mauvaise coordination des intermédiaires d'épissage, ce qui fait que le pré-ARNm ne subit pas un épissage précis. Comme PRP2 fait partie d'un réseau complexe d'hélicases et de facteurs d'épissage, les inhibiteurs de cette protéine peuvent fournir des informations précieuses sur les interactions ARN-protéines et sur la dynamique de l'assemblage et du désassemblage des spliceosomes, qui dépend de l'énergie. Ces composés servent de sondes moléculaires qui permettent d'approfondir notre compréhension de la fidélité et de la régulation de l'épissage de l'ARN au niveau structurel et biochimique.