Les inhibiteurs chimiques de Med18 peuvent exercer leurs effets inhibiteurs par divers mécanismes qui perturbent sa fonction au sein du complexe médiateur, un élément essentiel de la régulation de la transcription des gènes. La trichostatine A, par exemple, inhibe les histones désacétylases, ce qui entraîne une hyperacétylation des histones; cette modification peut entraver les capacités de recrutement et les activités de régulation transcriptionnelle de Med18. De même, le flavopiridol cible les kinases cycline-dépendantes dont l'activité est nécessaire à la phosphorylation des sous-unités du complexe médiateur; l'inhibition de ces kinases peut réduire la compétence fonctionnelle de Med18 dans le processus de transcription. L'ICG-001 se lie sélectivement à la protéine de liaison CREB, perturbant probablement son interaction avec le complexe médiateur et influençant ainsi l'activité de Med18. Le triptolide, en inhibant l'ARN polymérase II, peut entraver le rôle de Med18 dans la facilitation de la transcription, étant donné qu'il fait partie du complexe aidant la Pol II.
En outre, l'inhibiteur chimique DRB cible les CDK9 et CDK12, qui phosphorylent l'ARN polymérase II, et leur inhibition peut empêcher Med18 de participer efficacement à l'élongation de la transcription. Le silvestrol, en inhibant le facteur d'initiation eIF4A, peut diminuer la synthèse de Med18, ce qui conduit à son inhibition fonctionnelle. Le H-89, un inhibiteur de kinase, peut empêcher la phosphorylation des composants du complexe médiateur, ce qui affecte l'état opérationnel de Med18. Le C646, en inhibant l'acétyltransférase p300, peut réduire les niveaux d'acétylation de Med18 ou de ses facteurs associés, ce qui est essentiel pour sa fonction de régulation transcriptionnelle. Le bortézomib, par le biais de l'inhibition du protéasome, peut indirectement inhiber Med18 en séquestrant les ubiquitine ligases ou les cofacteurs essentiels à son activité. L'inhibition des CDK par le SNS-032 peut réduire la phosphorylation nécessaire de Med18, entravant ainsi son rôle transcriptionnel. Le MG-132 peut provoquer une accumulation de protéines mal repliées, entraînant une réponse au stress cellulaire qui peut inclure l'inhibition de Med18. Enfin, l'inhibition par JQ1 des protéines bromodomaines BET peut interférer avec le recrutement de Med18 sur la chromatine acétylée, inhibant ainsi son activité transcriptionnelle.
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