Les inhibiteurs chimiques de la MD-1 utilisent divers mécanismes pour entraver la fonction de cette protéine dans les voies de signalisation immunitaires. Le BAY 11-7082, le Parthénolide et le Wedelolactone exercent leurs effets inhibiteurs en ciblant la voie NF-κB, qui est intégralement liée à l'activité fonctionnelle de la MD-1. Le BAY 11-7082 inhibe spécifiquement la phosphorylation de IκBα, un événement précurseur de l'activation de NF-κB. De même, le parthénolide supprime le NF-κB en ciblant et en inhibant directement ce facteur de transcription, tandis que le wedelolactone agit comme un inhibiteur de l'IκB kinase, une enzyme clé dans le processus de phosphorylation qui active le NF-κB. L'émodine et l'andrographolide contribuent également à l'inhibition du NF-κB, l'émodine interférant avec l'activité kinase de l'IκB et l'andrographolide inhibant l'activation du NF-κB en modifiant les résidus cystéine dans sa voie d'activation.
Conjointement, le SN50, le PDTC, le QNZ (EVP4593), le TPCA-1, le JSH-23, l'IMD-0354 et le sulforaphane constituent un groupe d'inhibiteurs qui empêchent l'activation et la translocation nucléaire du NF-κB, étape critique pour que le MD-1 puisse exercer son rôle dans les réponses immunitaires. Le SN50 contient une séquence peptidique qui empêche la translocation nucléaire du NF-κB activé. Le PDTC bloque la modification oxydative de l'IκB, empêchant ainsi la dégradation qui conduirait autrement à l'activation du NF-κB. Le QNZ arrête la translocation de NF-κB vers le noyau et son activité transcriptionnelle subséquente. TPCA-1 inhibe sélectivement la IκB kinase-2, ce qui est crucial pour la dégradation de la IκB. Le JSH-23 empêche le NF-κB de pénétrer dans le noyau et de se lier à l'ADN, l'IMD-0354 inhibe l'IκB kinase et le sulforaphane bloque la dégradation de l'IκB. Ces diverses actions chimiques convergent vers un résultat commun: l'inhibition de NF-κB, réduisant ainsi l'activité fonctionnelle de MD-1 dans les cascades de signalisation immunitaire.
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