Inhibiteurs LMBRD1

Les inhibiteurs courants de LMBRD1 comprennent notamment la chloroquine CAS 54-05-7, l'hydroxychloroquine CAS 118-42-3, la bafilomycine A1 CAS 88899-55-2, la concanamycine A CAS 80890-47-7 et la méthyl-β-cyclodextrine CAS 128446-36-6.

Les inhibiteurs chimiques de LMBRD1 peuvent interférer avec son activité fonctionnelle par divers mécanismes, principalement en modifiant l'environnement lysosomal dans lequel LMBRD1 opère. La chloroquine et l'hydroxychloroquine, par exemple, sont capables d'inhiber LMBRD1 en augmentant le pH dans les lysosomes. L'augmentation du pH perturbe les processus acido-dépendants des protéines lysosomales telles que LMBRD1, qui ont besoin d'une plage de pH spécifique pour fonctionner correctement. De même, la Bafilomycine A1 et la Concanamycine A ciblent la H+-ATPase de type vacuolaire, empêchant l'acidification des lysosomes, qui est une condition préalable à l'activité de LMBRD1. En inhibant cette H+-ATPase, ces composés compromettent les conditions acides nécessaires au fonctionnement de LMBRD1.

En outre, la méthyl-β-cyclodextrine peut inhiber LMBRD1 en extrayant le cholestérol des membranes cellulaires, perturbant ainsi potentiellement les microenvironnements lipidiques essentiels à la localisation et à la fonction correctes de LMBRD1. L'U18666A inhibe également le trafic du cholestérol et, ce faisant, peut affecter la distribution du cholestérol dans les membranes lysosomales, ce qui est susceptible d'avoir un impact sur l'activité de LMBRD1. La génistéine, en inhibant les tyrosines kinases, peut interférer avec les processus dépendant de la phosphorylation dans les lysosomes qui pourraient être essentiels pour l'activation ou la stabilisation de LMBRD1. La monensine, en tant qu'ionophore monovalent, altère l'homéostasie ionique lysosomale, et cette perturbation peut conduire à l'inhibition de LMBRD1 en modifiant les gradients ioniques qui sont nécessaires à son activité. La leupeptine et la pepsatine A, deux inhibiteurs de protéase, inhibent la voie de la protéolyse lysosomale, ce qui pourrait à son tour inhiber LMBRD1 en empêchant le traitement protéolytique des protéines qui interagissent avec LMBRD1 ou qui sont impliquées dans la même voie que lui. Z-VAD-FMK, un inhibiteur de la pan-caspase, peut également inhiber les protéases lysosomales, ce qui pourrait conduire à l'inhibition de LMBRD1 en perturbant les processus de clivage protéolytique susceptibles de l'activer ou de le dégrader. Enfin, E64d agit comme un inhibiteur irréversible des protéases à cystéine dans les lysosomes, ce qui pourrait inhiber LMBRD1 en entravant l'activité protéasique nécessaire au traitement des molécules dans la voie LMBRD1.